RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299353.6

BORCS7-ASMT-201, Transcript of BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene BORCS7-ASMT, Length 2,670 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MTA1Q13330 715 aa7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 NFIL3Q16649 462 aa7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SEL1L2Q5TEA6 688 aa7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KRT39Q6A163 491 aa7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TRIM68Q6AZZ1 485 aa7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 FBXL13Q8NEE6 735 aa7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SHC3Q92529 594 aa7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KLHL29Q96CT2 875 aa7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 IFT74Q96LB3 600 aa7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 NT5C1BQ96P26 610 aa7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SYT15Q9BQS2 421 aa7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 C11orf70Q9BRQ4 267 aa7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 HAPLN2Q9GZV7 340 aa7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ASIC3Q9UHC3 531 aa7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 UBE4BO95155 1302 aa7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa7.37□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 E7ENQ6 273 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 GRIN3BO60391 1043 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 EDN1P05305 212 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SETSIPP0DME0 302 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MYBL1P10243 752 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 COILP38432 576 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MMP13P45452 471 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 NCKAP1LP55160 1127 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PRKCEQ02156 737 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CNTN2Q02246 1040 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KAZNQ674X7 775 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ASRGL1Q7L266 308 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 NEK9Q8TD19 979 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SEC14L1Q92503 715 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CD101Q93033 1021 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 HAUS1Q96CS2 278 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TXLNGYQ9BZA5 131 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 DEFB129Q9H1M3 183 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CDK2AP1O14519 115 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 WDR46O15213 610 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TP73O15350 636 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SP100P23497 879 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ANXA13P27216 316 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MAPK4P31152 587 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CDR2Q01850 454 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KRT17Q04695 432 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CYP24A1Q07973 514 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SGO2Q562F6 1265 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SPDYCQ5MJ68 293 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 HOOK3Q86VS8 718 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 C4orf19Q8IY42 314 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KIF2BQ8N4N8 673 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ANKRD42Q8N9B4 389 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 IFT43Q96FT9 208 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 WRNIP1Q96S55 665 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TBC1D22BQ9NU19 505 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 STK32BQ9NY57 414 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 HACL1Q9UJ83 578 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 STK38LQ9Y2H1 464 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MROH7Q68CQ1 1323 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ZNF541Q9H0D2 1346 aa7.36□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SNX3O60493 162 aa7.35□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 GH1P01241 217 aa7.35□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KRT10P13645 584 aa7.35□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 GBP1P32455 592 aa7.35□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ORC1Q13415 861 aa7.35□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KYNUQ16719 465 aa7.35□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.35□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TMEM270Q6UE05 265 aa7.35□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ANKRD23Q86SG2 305 aa7.35□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.35□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.35□□□□□ -1.23
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 OR5B17Q8NGF7 314 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms