RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 EXD1Q8NHP7 514 aa24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 LPPQ93052 612 aa24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 MCRS1Q96EZ8 462 aa24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 GDAP2Q9NXN4 497 aa24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 THSD7BQ9C0I4 1608 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 TULP2O00295 520 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 PDGFRBP09619 1106 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 LMO2P25791 158 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 MLH1P40692 756 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.435e-7■■■■■ 27.5
VSTM4-201ENST00000298454 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 DUPD1Q68J44 220 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 UNC93AQ86WB7 457 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC105Q8IYK2 499 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC19Q9H756 370 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 CREBZFQ9NS37 354 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 CEP350Q5VT06 3117 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 E5RJQ4 531 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 PI4K2BG5E9Z4 385 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 AGPSO00116 658 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 HOXD10P28358 340 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 FAM193AP78312 1265 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 STILQ15468 1287 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 GSTCDQ8NEC7 633 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 ATG4AQ8WYN0 398 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 CHST12Q9NRB3 414 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 CHST7Q9NS84 486 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 CACNG4Q9UBN1 327 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 GPR182O15218 404 aa24■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 GHRP10912 638 aa24■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 CD52P31358 61 aa24■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 GGCXP38435 758 aa24■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 RGS7P49802 495 aa24■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 LILRA4P59901 499 aa24■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 SNX1Q13596 522 aa24■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 ITGA7Q13683 1181 aa24■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 PKDCCQ504Y2 493 aa24■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa24■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 RAET1EQ8TD07 263 aa24■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 GAD1Q99259 594 aa24■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 OSBPL8Q9BZF1 889 aa24■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 FAM114A2Q9NRY5 505 aa24■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA6BA6NDN3 693 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 SYF2O95926 243 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 SV2CQ496J9 727 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC38Q5VT99 294 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 PMF1Q6P1K2 205 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 RNF180Q86T96 592 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 APPL2Q8NEU8 664 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 PADI3Q9ULW8 664 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 KRT1P04264 644 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 LRPAP1P30533 357 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 FLT3P36888 993 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 FNTAP49354 379 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 ACLYP53396 1101 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 FNIP1Q8TF40 1166 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 RASAL2Q9UJF2 1139 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 SNX24Q9Y343 169 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 LRCH4O75427 683 aa23.98■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 HSP90B2PQ58FF3 399 aa23.98■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa23.98■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 MAIP1Q8WWC4 291 aa23.98■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.98■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 MIOSQ9NXC5 875 aa23.98■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 MGEA5O60502 916 aa23.98■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC130P13994 396 aa23.98■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 OR6B2Q6IFH4 312 aa23.98■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 MFSD7Q6UXD7 560 aa23.98■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 LIMS2Q7Z4I7 341 aa23.98■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 RCOR2Q8IZ40 523 aa23.98■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 SNX25Q9H3E2 840 aa23.98■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 NOD1Q9Y239 953 aa23.98■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 HUS1O60921 280 aa23.97■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 KRT10P13645 584 aa23.97■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 ADCY2Q08462 1091 aa23.97■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 AGMOQ6ZNB7 445 aa23.97■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRF2Q8IZF7 708 aa23.97■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 MREGQ8N565 214 aa23.97■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 SLC35F5Q8WV83 523 aa23.97■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 RAPGEF5Q92565 580 aa23.97■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 RUNDC3BQ96NL0 473 aa23.97■■□□□ 1.43
VSTM4-201ENST00000298454 FAM118BQ9BPY3 351 aa23.97■■□□□ 1.43
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