RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 TEAD2Q15562 447 aa26.81■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 CBWD6Q4V339 395 aa26.81■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 CBWD3Q5JTY5 395 aa26.81■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 CBWD5Q5RIA9 395 aa26.81■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 SLC44A3Q8N4M1 653 aa26.81■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 MLKLQ8NB16 471 aa26.81■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa26.81■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 SHKBP1Q8TBC3 707 aa26.81■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 FGF14Q92915 247 aa26.81■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 SLC35C1Q96A29 364 aa26.81■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 NIF3L1Q9GZT8 377 aa26.81■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 RAB20Q9NX57 234 aa26.81■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 RWDD2AQ9UIY3 292 aa26.81■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 MYO10Q9HD67 2058 aa26.81■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 LRRN2O75325 713 aa26.8■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 MOSPD3O75425 235 aa26.8■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 GABRR2P28476 465 aa26.8■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 WDR44Q5JSH3 913 aa26.8■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 STKLD1Q8NE28 680 aa26.8■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 GPT2Q8TD30 523 aa26.8■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 SEMA4DQ92854 862 aa26.8■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 TNIP3Q96KP6 325 aa26.8■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 GCNAQ96QF7 691 aa26.8■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 ATXN3LQ9H3M9 355 aa26.8■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 TMEM221A6NGB7 291 aa26.79■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 M0R296 226 aa26.79■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 GNA14O95837 355 aa26.79■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 GRIK1P39086 918 aa26.79■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 MAGEA11P43364 429 aa26.79■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 NDST1P52848 882 aa26.79■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 KXD1Q9BQD3 176 aa26.79■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 LRFN3Q9BTN0 628 aa26.79■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 BCO2Q9BYV7 579 aa26.79■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 DUSP12Q9UNI6 340 aa26.79■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 PRR33A8MZF0 331 aa26.78■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 NARSO43776 548 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 CSH1P0DML2 217 aa26.78■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 CSH2P0DML3 217 aa26.78■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 ANXA13P27216 316 aa26.78■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 ORC1Q13415 861 aa26.78■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa26.78■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 VSTM1Q6UX27 236 aa26.78■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 GAREM2Q75VX8 874 aa26.78■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 ACOT1Q86TX2 421 aa26.78■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 MED10Q9BTT4 135 aa26.78■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 CYP3A43Q9HB55 503 aa26.78■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 CD58P19256 250 aa26.77■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 CDC25CP30307 473 aa26.77■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 POTEHQ6S545 545 aa26.77■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 UNC93AQ86WB7 457 aa26.77■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 ZSWIM3Q96MP5 696 aa26.77■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 B3GNT5Q9BYG0 378 aa26.77■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 GPR88Q9GZN0 384 aa26.77■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 ELOVL4Q9GZR5 314 aa26.77■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 HMGXB4Q9UGU5 601 aa26.77■■□□□ 1.88
PDF-201ENST00000288022 ATP8B3O60423 1300 aa26.76■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 SLC38A8A6NNN8 435 aa26.76■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 CLDN5O00501 218 aa26.76■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 FMO5P49326 533 aa26.76■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 FAM78AQ5JUQ0 283 aa26.76■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 CREBRFQ8IUR6 639 aa26.76■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa26.76■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 DACH1Q9UI36 760 aa26.76■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 FBXL21Q9UKT6 434 aa26.76■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 TRIM66O15016 1216 aa26.75■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 CCDC192P0DO97 292 aa26.75■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 SRFP11831 508 aa26.75■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 NLRP12P59046 1061 aa26.75■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 CYP4F8P98187 520 aa26.75■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 DPCR1Q3MIW9 517 aa26.75■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 STXBP5Q5T5C0 1151 aa26.75■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 GPR158Q5T848 1215 aa26.75■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 SMARCD2Q92925 531 aa26.75■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 PBXIP1Q96AQ6 731 aa26.75■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 ASIC4Q96FT7 647 aa26.75■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 ASB16Q96NS5 453 aa26.75■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 IL21Q9HBE4 155 aa26.75■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 ZFP14Q9HCL3 533 aa26.75■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 COQ4Q9Y3A0 265 aa26.75■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 ECI2O75521 394 aa26.74■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 NOL4O94818 638 aa26.74■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 MBD3O95983 291 aa26.74■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 CFHP08603 1231 aa26.74■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 INCA1Q0VD86 236 aa26.74■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 TANGO2Q6ICL3 276 aa26.74■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 HFE2Q6ZVN8 426 aa26.74■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 TATDN2Q93075 761 aa26.74■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 NT5C1AQ9BXI3 368 aa26.74■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 DNAI2Q9GZS0 605 aa26.74■■□□□ 1.87
PDF-201ENST00000288022 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 178.8 ms