RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258457.6

C2orf49-201, Transcript of chromosome 2 open reading frame 49, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C2orf49, Length 4,768 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf49-201ENST00000258457 KDM4CQ9H3R0 1056 aa10□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa10□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 SPASTQ9UBP0 616 aa10□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 SMIM22K7EJ46 135 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 JCHAINP01591 159 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 GLI1P08151 1106 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 KCNA4P22459 653 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 RANBP1P43487 201 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 RFX3P48380 749 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 PPATQ06203 517 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 ARHGEF7Q14155 803 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 MMGT1Q8N4V1 131 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 SLITRK1Q96PX8 696 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 MAP3K14Q99558 947 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 OGTO15294 1046 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 STX7O15400 261 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 RHOBTB1O94844 696 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 KCNA3P22001 575 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 CAP2P40123 477 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 SERPINB4P48594 390 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 BMPR2Q13873 1038 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 TMEM154Q6P9G4 183 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 MIER2Q8N344 545 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 HDAC7Q8WUI4 952 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 TATDN2Q93075 761 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 MTMR8Q96EF0 704 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 CAAP1Q9H8G2 361 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 ANKEF1Q9NU02 776 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 DPP3Q9NY33 737 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 MED14O60244 1454 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 MAFGO15525 162 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 PPP4CP60510 307 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 GTF2H3Q13889 308 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 EFHC1Q5JVL4 640 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 CPB2Q96IY4 423 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 KCNK16Q96T55 309 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 TRIM62Q9BVG3 475 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 TEX12Q9BXU0 123 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 CD248Q9HCU0 757 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 PKD2L2Q9NZM6 624 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 ZNF212Q9UDV6 495 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 FZD1Q9UP38 647 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 KCNH4Q9UQ05 1017 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 NRKQ7Z2Y5 1582 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 C5orf58C9J3I9 102 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 H0Y626 953 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 TRIM16O95361 564 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 SERPINB5P36952 375 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 RFC5P40937 340 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 TAF6P49848 677 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 NUDT2P50583 147 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 KRT72Q14CN4 511 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 DGKDQ16760 1214 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 YAF2Q8IY57 180 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 DNAJC9Q8WXX5 260 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 TUBGCP3Q96CW5 907 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 PIF1Q9H611 641 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 L1RE1Q9UN81 338 aa9.99□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 A0A1W2PQJ5 194 aa9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 CELF2O95319 508 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 ZCCHC18P0CG32 403 aa9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 SERPINB9P50453 376 aa9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 INPP5AQ14642 412 aa9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 NOTUMQ6P988 496 aa9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 LRIG3Q6UXM1 1119 aa9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 ACTL9Q8TC94 416 aa9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 CMTM5Q96DZ9 223 aa9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 ABHD8Q96I13 439 aa9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 ZFYVE19Q96K21 471 aa9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 MYO9BQ13459 2157 aa9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 TSPOAP1O95153 1857 aa9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 KYAT1Q16773 422 aa9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 TRIM60Q495X7 471 aa9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 MICU2Q8IYU8 434 aa9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.98□□□□□ -0.81
C2orf49-201ENST00000258457 GLT1D1Q96MS3 346 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms