RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258243.6

URB2-201, Transcript of URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene URB2, Length 5,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2-201ENST00000258243 GOLGA8MH3BSY2 632 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 GRAMD1BQ3KR37 738 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 CDH24Q86UP0 819 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 C4orf19Q8IY42 314 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 ENGASEQ8NFI3 743 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 TRPM4Q8TD43 1214 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 FBXO32Q969P5 355 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 NDEL1Q9GZM8 345 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 TRPV2Q9Y5S1 764 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 C3P01024 1663 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 IMPG1Q17R60 797 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 KLHL38Q2WGJ6 581 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 DCAF6Q58WW2 860 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 RIOX1Q9H6W3 641 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 ZFP69BQ9UJL9 534 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 CARNS1A5YM72 827 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 CASP7P55210 303 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 IKBKEQ14164 716 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 LRRC37BQ96QE4 947 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 GID8Q9NWU2 228 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 HPS5Q9UPZ3 1129 aa11.35□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 AP1G2O75843 785 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 BRAFP15056 766 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 DNAJB2P25686 324 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 WASHC5Q12768 1159 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 ADGRF2Q8IZF7 708 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 WNK4Q96J92 1243 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 MS4A14Q96JA4 679 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 MCEEQ96PE7 176 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 CCDC78A2IDD5 438 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 HSPA4LO95757 839 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 KLRC2P26717 231 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 AKT1P31749 480 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 DMPKQ09013 629 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 GPS1Q13098 491 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 GPAT2Q6NUI2 795 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 ZNF677Q86XU0 584 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 REPS2Q8NFH8 660 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 UVRAGQ9P2Y5 699 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 KPNA7A9QM74 516 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 IRF6O14896 467 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 GPD1P21695 349 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 GTF2H1P32780 548 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 ADCYAP1R1P41586 468 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 LHX1P48742 406 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 AMHR2Q16671 573 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 SLC30A5Q8TAD4 765 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 THAP11Q96EK4 314 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 FOPNLQ96NB1 174 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 OLFM1Q99784 485 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 GPRC5CQ9NQ84 441 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 COPEO14579 308 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 DIAPH2O60879 1101 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 GHRP10912 638 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 SEC24CP53992 1094 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 SZRD1Q7Z422 152 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 SLC4A9Q96Q91 983 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 APBA2Q99767 749 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 TINF2Q9BSI4 451 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 AMACRQ9UHK6 382 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 GGT7Q9UJ14 662 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 PHF20L1A8MW92 1017 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 MED24O75448 989 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 CKMP06732 381 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 NPTX2P47972 431 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 KDELC2Q7Z4H8 507 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 TEX12Q9BXU0 123 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 ING2Q9H160 280 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 TAF6LQ9Y6J9 622 aa11.34□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 H3BQF6 201 aa11.33□□□□□ -0.6
URB2-201ENST00000258243 ZNF197O14709 1029 aa11.33□□□□□ -0.6
URB2-201ENST00000258243 IGFBP4P22692 258 aa11.33□□□□□ -0.6
URB2-201ENST00000258243 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
URB2-201ENST00000258243 AXLP30530 894 aa11.33□□□□□ -0.6
URB2-201ENST00000258243 CHRNA3P32297 505 aa11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms