RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 LCA5LO95447 670 aa27.67■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 BMP8BP34820 402 aa27.67■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 GLUD2P49448 558 aa27.67■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 TAP1Q03518 808 aa27.67■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 KRT17Q04695 432 aa27.67■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 ARHGAP17Q68EM7 881 aa27.67■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 SMYD5Q6GMV2 418 aa27.67■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 FAM171BQ6P995 826 aa27.67■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 ANKS3Q6ZW76 656 aa27.67■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 TDHQ8IZJ6 230 aa27.67■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 WDTC1Q8N5D0 677 aa27.67■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa27.67■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa27.67■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa27.67■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 TULP2O00295 520 aa27.66■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 ANXA13P27216 316 aa27.66■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 NOMO3P69849 1222 aa27.66■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 PLCB3Q01970 1234 aa27.66■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 DSG1Q02413 1049 aa27.66■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 C2CD6Q53TS8 623 aa27.66■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 PIK3R5Q8WYR1 880 aa27.66■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 PGLYRP2Q96PD5 576 aa27.66■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 CDY1Q9Y6F8 540 aa27.66■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 RCCD1A6NED2 376 aa27.65■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 TBC1D4O60343 1298 aa27.65■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 UNGP13051 313 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 DNAJB1P25685 340 aa27.65■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 SPA17Q15506 151 aa27.65■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa27.65■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 PTPRDP23468 1912 aa27.65■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 CARNS1A5YM72 827 aa27.64■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 USP27XA6NNY8 438 aa27.64■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 URODP06132 367 aa27.64■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 CA8P35219 290 aa27.64■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 CACNA2D1P54289 1103 aa27.64■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 FAM35AQ86V20 835 aa27.64■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 DNAI2Q9GZS0 605 aa27.64■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 ZBP1Q9H171 429 aa27.64■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 KRT82Q9NSB4 513 aa27.64■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM30AQ9NV96 361 aa27.64■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 MTRRQ9UBK8 725 aa27.64■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa27.64■■■□□ 2.02
TOMM40-201ENST00000252487 OR6C75A6NL08 312 aa27.64■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 H7C4K7 107 aa27.64■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 CPB1P15086 417 aa27.64■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa27.64■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 CDH23Q9H251 3354 aa27.63■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 BEST1O76090 585 aa27.63■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 FTLP02792 175 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 MAGEA1P43355 309 aa27.63■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 PKDCCQ504Y2 493 aa27.63■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 TRIM72Q6ZMU5 477 aa27.63■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 FBXO22Q8NEZ5 403 aa27.63■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 HESX1Q9UBX0 185 aa27.63■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 TJP2Q9UDY2 1190 aa27.63■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 RWDD3Q9Y3V2 267 aa27.63■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 ABL1P00519 1130 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 ABCB4P21439 1286 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 BDNFP23560 247 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 OR1D2P34982 312 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 GPD2P43304 727 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 RGS7P49802 495 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 ERVFC1P60507 584 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 PDE4CQ08493 712 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 STILQ15468 1287 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 ACAD10Q6JQN1 1059 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM35BQ8NCS4 154 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 KIAA1524Q8TCG1 905 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 SPPL3Q8TCT6 385 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 CLSTN3Q9BQT9 956 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 PLVAPQ9BX97 442 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 LHX5Q9H2C1 402 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 MSRAQ9UJ68 235 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 MYO7AQ13402 2215 aa27.62■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 PIK3R2O00459 728 aa27.61■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 GRM6O15303 877 aa27.61■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 LSM8O95777 96 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 CCDC175P0C221 793 aa27.61■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 CENPCQ03188 943 aa27.61■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 PTPN14Q15678 1187 aa27.61■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 LLGL2Q6P1M3 1020 aa27.61■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 TTC9BQ8N6N2 239 aa27.61■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 ANKRD52Q8NB46 1076 aa27.61■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 POF1BQ8WVV4 589 aa27.61■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 PRO3102Q9H379 93 aa27.61■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 TRIM10Q9UDY6 481 aa27.61■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 C5orf67F2Z3F1 127 aa27.61■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 RTN2O75298 545 aa27.61■■■□□ 2.01
TOMM40-201ENST00000252487 VNN2O95498 520 aa27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms