RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 RIPK3Q9Y572 518 aa23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 K7ERI5 159 aa23.24■■□□□ 1.31
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HTATSF1-201ENST00000218364 ATP6V1C1P21283 382 aa23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa23.24■■□□□ 1.31
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 MIPEPQ99797 713 aa23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 TUBB6Q9BUF5 446 aa23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 DCLRE1BQ9H816 532 aa23.24■■□□□ 1.31
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HTATSF1-201ENST00000218364 WDTC1Q8N5D0 677 aa23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 RFWD2Q8NHY2 731 aa23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC8Q8TAM2 541 aa23.24■■□□□ 1.31
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HTATSF1-201ENST00000218364 ACTL9Q8TC94 416 aa23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM143Q96AN5 459 aa23.23■■□□□ 1.31
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HTATSF1-201ENST00000218364 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.23■■□□□ 1.31
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HTATSF1-201ENST00000218364 FBXO36Q8NEA4 188 aa23.23■■□□□ 1.31
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZFATQ9P243 1243 aa23.23■■□□□ 1.31
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HTATSF1-201ENST00000218364 GCKP35557 465 aa23.23■■□□□ 1.31
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HTATSF1-201ENST00000218364 TGFB2P61812 414 aa23.23■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.23■■□□□ 1.31
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HTATSF1-201ENST00000218364 GINM1Q9NU53 330 aa23.22■■□□□ 1.31
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HTATSF1-201ENST00000218364 EDN1P05305 212 aa23.22■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 ACADSP16219 412 aa23.22■■□□□ 1.31
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HTATSF1-201ENST00000218364 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa23.22■■□□□ 1.31
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HTATSF1-201ENST00000218364 WDR91A4D1P6 747 aa23.21■■□□□ 1.31
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HTATSF1-201ENST00000218364 SP4Q02446 784 aa23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 CHSY1Q86X52 802 aa23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 BTBD10Q9BSF8 475 aa23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 DCTN4Q9UJW0 460 aa23.21■■□□□ 1.31
HTATSF1-201ENST00000218364 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.21■■□□□ 1.31
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HTATSF1-201ENST00000218364 GRM1Q13255 1194 aa23.21■■□□□ 1.31
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HTATSF1-201ENST00000218364 BRSK2Q8IWQ3 736 aa23.21■■□□□ 1.31
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HTATSF1-201ENST00000218364 PTPRN2Q92932 1015 aa23.21■■□□□ 1.31
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HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.2■■□□□ 1.3
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HTATSF1-201ENST00000218364 KRT7P08729 469 aa23.2■■□□□ 1.3
HTATSF1-201ENST00000218364 OVGP1Q12889 678 aa23.2■■□□□ 1.3
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR49Q8IV35 697 aa23.2■■□□□ 1.3
HTATSF1-201ENST00000218364 THNSL1Q8IYQ7 743 aa23.2■■□□□ 1.3
HTATSF1-201ENST00000218364 WNK4Q96J92 1243 aa23.2■■□□□ 1.3
HTATSF1-201ENST00000218364 CISHQ9NSE2 258 aa23.2■■□□□ 1.3
HTATSF1-201ENST00000218364 HEY2Q9UBP5 337 aa23.2■■□□□ 1.3
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM63AO94886 807 aa23.2■■□□□ 1.3
HTATSF1-201ENST00000218364 IL1BP01584 269 aa23.2■■□□□ 1.3
HTATSF1-201ENST00000218364 LMNTD2Q8IXW0 634 aa23.2■■□□□ 1.3
HTATSF1-201ENST00000218364 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa23.2■■□□□ 1.3
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