RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000194530.7

STRADB-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STRADB, Length 2,293 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-201ENST00000194530 ACKR2O00590 384 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 MARK3P27448 753 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 GPX6P59796 221 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 DYNLT1P63172 113 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 E2F5Q15329 346 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 FBF1Q8TES7 1133 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 PYROXD1Q8WU10 500 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 RSAD2Q8WXG1 361 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 POLIQ9UNA4 740 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 GOLGA8MH3BSY2 632 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 SMAPO00193 183 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 ALADP13716 330 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 CCNB1P14635 433 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 CA4P22748 312 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 MYO1EQ12965 1108 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 DNAJC3Q13217 504 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 SETDB1Q15047 1291 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 ANKMY2Q8IV38 441 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 C4orf33Q8N1A6 199 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 ATP11CQ8NB49 1132 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 CPT1BQ92523 772 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 KIF9Q9HAQ2 790 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 RABGEF1Q9UJ41 708 aa21.8■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 TYROBPO43914 113 aa21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 PEX10O60683 326 aa21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 IL1R2P27930 398 aa21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 TFDP1Q14186 410 aa21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 SMTNL2Q2TAL5 461 aa21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 TREML2Q5T2D2 321 aa21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 HHATQ5VTY9 493 aa21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 NCAPG2Q86XI2 1143 aa21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 NAT8LQ8N9F0 302 aa21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 LRRC8CQ8TDW0 803 aa21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 FZD8Q9H461 694 aa21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 CYTH4Q9UIA0 394 aa21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 USH1CQ9Y6N9 552 aa21.79■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 LGR5O75473 907 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 ATP5HO75947 161 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 IL18RAPO95256 599 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 RHPN2Q8IUC4 686 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 GPR20Q99678 358 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 BCO2Q9BYV7 579 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 SYNCQ9H7C4 482 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 A0A1W2PPM1 405 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 KRT19P08727 400 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 RPL22P35268 128 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 YARSP54577 528 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 OSTNP61366 133 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 ACAP1Q15027 740 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 EEPD1Q7L9B9 569 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 XYLT1Q86Y38 959 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 KCTD6Q8NC69 237 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 TBC1D31Q96DN5 1066 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 TXLNGQ9NUQ3 528 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 GGA3Q9NZ52 723 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 CLUHO75153 1309 aa21.78■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 EDF1O60869 148 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 UNC5CO95185 931 aa21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 ZWINTO95229 277 aa21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 KRT16P08779 473 aa21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 BAG6P46379 1132 aa21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 RAD23BP54727 409 aa21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 GDF10P55107 478 aa21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 PRKG1Q13976 671 aa21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 SLC1A5Q15758 541 aa21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 KLHL38Q2WGJ6 581 aa21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 FNBP1LQ5T0N5 605 aa21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 ANKRD22Q5VYY1 191 aa21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 KIF2BQ8N4N8 673 aa21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 GIMAP7Q8NHV1 300 aa21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 TJP2Q9UDY2 1190 aa21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 E7ESA3 106 aa21.77■■□□□ 1.08
STRADB-201ENST00000194530 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms