RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 ERBB2P04626 1255 aa8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 IVDP26440 423 aa8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 CHKAP35790 457 aa8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 CDKN2BP42772 138 aa8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 NDST1P52848 882 aa8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 VCPP55072 806 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 ACAP1Q15027 740 aa8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 CNGA2Q16280 664 aa8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 P3H1Q32P28 736 aa8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 MFSD5Q6N075 450 aa8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 NOTUMQ6P988 496 aa8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 SLC27A1Q6PCB7 646 aa8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 BEST2Q8NFU1 509 aa8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 JOSD2Q8TAC2 188 aa8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 CXorf38Q8TB03 319 aa8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 SETD4Q9NVD3 440 aa8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 CYTH4Q9UIA0 394 aa8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 DNPEPQ9ULA0 475 aa8.7□□□□□ -1.02
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VAMP3-201ENST00000054666 NRCAMQ92823 1304 aa8.7□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 SGK1O00141 431 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 KIAA0754O94854 1291 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 TTC4O95801 387 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 KLRC2P26717 231 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 SLCO1A2P46721 670 aa8.69□□□□□ -1.02
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VAMP3-201ENST00000054666 ARSEP51690 589 aa8.69□□□□□ -1.02
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VAMP3-201ENST00000054666 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM62Q0P6H9 643 aa8.69□□□□□ -1.02
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VAMP3-201ENST00000054666 MARCH8Q5T0T0 291 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 ALLCQ8N6M5 410 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 RAPGEF5Q92565 580 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 HAUS1Q96CS2 278 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 SNX27Q96L92 541 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 SERPINB12Q96P63 405 aa8.69□□□□□ -1.02
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VAMP3-201ENST00000054666 AAASQ9NRG9 546 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 ASNSD1Q9NWL6 643 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.69□□□□□ -1.02
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VAMP3-201ENST00000054666 GMNCA6NCL1 334 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 MYO1CO00159 1063 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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VAMP3-201ENST00000054666 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.69□□□□□ -1.02
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VAMP3-201ENST00000054666 GPD2P43304 727 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 SNX16P57768 344 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 DYNLT1P63172 113 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 IRF5Q13568 498 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 TLK2Q86UE8 772 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 EMC1Q8N766 993 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 MCRS1Q96EZ8 462 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 CCT8L2Q96SF2 557 aa8.69□□□□□ -1.02
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VAMP3-201ENST00000054666 PCDH9Q9HC56 1237 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 SNTG2Q9NY99 539 aa8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 TP73O15350 636 aa8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 TRAPPC3O43617 180 aa8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 IFNB1P01574 187 aa8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 GPD1P21695 349 aa8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 MMP13P45452 471 aa8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 SEC24CP53992 1094 aa8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 PDE4CQ08493 712 aa8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 GPS1Q13098 491 aa8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 MORF4L2Q15014 288 aa8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 LONRF1Q17RB8 773 aa8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 OR6B2Q6IFH4 312 aa8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 RFX6Q8HWS3 928 aa8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 LRRC52Q8N7C0 313 aa8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 KCTD6Q8NC69 237 aa8.68□□□□□ -1.02
VAMP3-201ENST00000054666 UBA3Q8TBC4 463 aa8.68□□□□□ -1.02
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