RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635258.1

LINC01427-202, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1427, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC01427, Length 4,566 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01427-202ENST00000635258 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 BSNDQ8WZ55 320 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 SHISA4Q96DD7 197 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 IL23AQ9NPF7 189 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 FAM169AQ9Y6X4 670 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 BTNL10A8MVZ5 291 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 RAD51Q06609 339 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 TPGS2Q68CL5 300 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 CCDC91Q7Z6B0 441 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 TTC1Q99614 292 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 CCDC85CA6NKD9 419 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 EFCAB8A8MWE9 144 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 WARSP23381 471 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 MLH1P40692 756 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 SLC11A2P49281 568 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 SCNN1GP51170 649 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 CASP5P51878 434 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 ANO4Q32M45 955 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 STK32AQ8WU08 396 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 IRGQQ8WZA9 623 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 SHC3Q92529 594 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 SIK3Q9Y2K2 1263 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 ASB3Q9Y575 518 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 TLL1O43897 1013 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 GLUD2P49448 558 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 FAM71AQ8IYT1 594 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 DAW1Q8N136 415 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 ACBD6Q9BR61 282 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 TTPALQ9BTX7 342 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 ASIC3Q9UHC3 531 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 BUB1O43683 1085 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 ADAMTS4O75173 837 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 ADRB2P07550 413 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 WEE2P0C1S8 567 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 AKAP5P24588 427 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 APBA1Q02410 837 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 FAM228AQ86W67 206 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 ERVK-5Q9HDB9 667 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 UQCRHLA0A096LP55 91 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 NCK2O43639 380 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 PEX10O60683 326 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 POMCP01189 267 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 UQCRHP07919 91 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 PDGFRAP16234 1089 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 HTR7P34969 479 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 PMS1P54277 932 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 GALCP54803 685 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 CCL23P55773 120 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 BRD3Q15059 726 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 DESI2Q9BSY9 194 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 CNPY3Q9BT09 278 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 SPTLC3Q9NUV7 552 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 H7C0C1 242 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 RB1P06400 928 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 PDGFRBP09619 1106 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 PRLRP16471 622 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 ATP5OP48047 213 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 GJA8P48165 433 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 SULT1E1P49888 294 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 NDST1P52848 882 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 RABGAP1LQ5R372 815 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 ARMC5Q96C12 935 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC01427-202ENST00000635258 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms