RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622431.4

SORCS1-210, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SORCS1, Length 6,701 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-210ENST00000622431 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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SORCS1-210ENST00000622431 KDSRQ06136 332 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-210ENST00000622431 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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SORCS1-210ENST00000622431 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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SORCS1-210ENST00000622431 CDH18Q13634 790 aa7.3□□□□□ -1.24
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SORCS1-210ENST00000622431 VPS33BQ9H267 617 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-210ENST00000622431 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.3□□□□□ -1.24
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SORCS1-210ENST00000622431 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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SORCS1-210ENST00000622431 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.29□□□□□ -1.24
SORCS1-210ENST00000622431 FBXO28Q9NVF7 368 aa7.29□□□□□ -1.24
SORCS1-210ENST00000622431 KIAA1257Q9ULG3 409 aa7.29□□□□□ -1.24
SORCS1-210ENST00000622431 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa7.29□□□□□ -1.24
SORCS1-210ENST00000622431 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.29□□□□□ -1.24
SORCS1-210ENST00000622431 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SORCS1-210ENST00000622431 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
SORCS1-210ENST00000622431 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
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