RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 SV2BQ7L1I2 683 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf127Q8N9H9 656 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 SAAL1Q96ER3 474 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 PI4K2AQ9BTU6 479 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 HPS4Q9NQG7 708 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 SEMA4GQ9NTN9 838 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 TDP1Q9NUW8 608 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 L1RE1Q9UN81 338 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 AGAP1Q9UPQ3 857 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRF-216ENST00000617451 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 SOBPA7XYQ1 873 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 ITGB3P05106 788 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 CSH1P0DML2 217 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 CSH2P0DML3 217 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 GPR15P49685 360 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 CUL4AQ13619 759 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 RUNX3Q13761 415 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 CSRP2Q16527 193 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM196Q5HYL7 178 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 TXNDC8Q6A555 127 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 WDR5BQ86VZ2 330 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 CXorf38Q8TB03 319 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 NETO1Q8TDF5 533 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 CLIC6Q96NY7 704 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 ACBD6Q9BR61 282 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 OLFML3Q9NRN5 406 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 ACACBO00763 2458 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 DENND4CQ5VZ89 1909 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 EXTL3O43909 919 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 GCNT3O95395 438 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 LDHAP00338 332 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 GARTP22102 1010 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 CASP5P51878 434 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 BFSP1Q12934 665 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM68Q6AZZ1 485 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 MON1AQ86VX9 555 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC52Q8N7C0 313 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 CHFRQ96EP1 664 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 EBF3Q9H4W6 596 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 KIF9Q9HAQ2 790 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 ABCB6Q9NP58 842 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 SLC30A4O14863 429 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 HUS1O60921 280 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 PDCP20941 246 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 TXLNAP40222 546 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP26.8■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 SDHAF4Q5VUM1 108 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 SCARA3Q6AZY7 606 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 FSTL4Q6MZW2 842 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 PKN3Q6P5Z2 889 aa26.8■■□□□ 1.88
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PTPRF-216ENST00000617451 TMEM86AQ8N2M4 240 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
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PTPRF-216ENST00000617451 RIN3Q8TB24 985 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 PKMYT1Q99640 499 aa26.8■■□□□ 1.88
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PTPRF-216ENST00000617451 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
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PTPRF-216ENST00000617451 CYP2F1P24903 491 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 DDR2Q16832 855 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 GDAP2Q9NXN4 497 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 ITGA11Q9UKX5 1188 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 SDK1Q7Z5N4 2213 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 FRMD3A2A2Y4 597 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 NOL4O94818 638 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
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PTPRF-216ENST00000617451 ALCAMQ13740 583 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 FAM173BQ6P4H8 233 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 SYCP3Q8IZU3 236 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA18Q8TC71 538 aa26.78■■□□□ 1.88
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PTPRF-216ENST00000617451 FAM84AQ96KN4 292 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 MYRFLQ96LU7 910 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 CBWD1Q9BRT8 395 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 GTF3C4Q9UKN8 822 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA8IPA6NC78 632 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA8JA6NMD2 632 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
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