RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	PAX3	P23760	479 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNA1	Q09470	495 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	RUNX3	Q13761	415 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	RABEP1	Q15276	862 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	TXNDC8	Q6A555	127 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	USP49	Q70CQ1	688 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	KBTBD6	Q86V97	674 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	METTL23	Q86XA0	190 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	SFR1	Q86XK3	245 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	GAB3	Q8WWW8	586 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	KPNA7	A9QM74	516 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	AXIN1	O15169	862 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	HCRT	O43612	131 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF40	O75150	1001 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	EPN2	O95208	641 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNA4	P22459	653 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	AVPR1A	P37288	418 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	RAP1GAP	P47736	663 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	TAF12	Q16514	161 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	SV2C	Q496J9	727 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	STRA6	Q9BX79	667 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	L1RE1	Q9UN81	338 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	NUP205	Q92621	2012 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	SMARCB1	Q12824	385 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	BFSP1	Q12934	665 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	DYM	Q7RTS9	669 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	OSTM1	Q86WC4	334 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	CXorf38	Q8TB03	319 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	SAAL1	Q96ER3	474 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	EPSTI1	Q96J88	318 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF560	Q96MR9	790 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	HHIP	Q96QV1	700 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC22A12	Q96S37	553 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	PKMYT1	Q99640	499 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	TDP1	Q9NUW8	608 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	TM4SF5	O14894	197 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	NOL4	O94818	638 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGB3	P05106	788 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF806	P0C7X5	589 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP2F1	P24903	491 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	ABCD1	P33897	745 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	GJA4	P35212	333 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	CASP5	P51878	434 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	LIMK1	P53667	647 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPY1	Q01534	308 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	USP4	Q13107	963 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF77	Q15935	545 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	DDR2	Q16832	855 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	ST3GAL2	Q16842	350 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	MON1A	Q86VX9	555 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	TCEAL3	Q969E4	200 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	HVCN1	Q96D96	273 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	MYMK	A6NI61	221 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	IL18RAP	O95256	599 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-233	ENST00000602338	BMP15	O95972	392 aa		12.84	□□□□□ -0.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms