RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 NT5DC3Q86UY8 548 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 THEM5Q8N1Q8 247 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 STK32AQ8WU08 396 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 TFAP2BQ92481 460 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 SENP8Q96LD8 212 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNK3O14649 394 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 MCM3P25205 808 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 MAN1A1P33908 653 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 ACADSBP45954 432 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 BCAT1P54687 386 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 GSCP56915 257 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 UPP1Q16831 310 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 SCARA3Q6AZY7 606 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 DENND1BQ6P3S1 775 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 ACOT1Q86TX2 421 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 C3orf20Q8ND61 904 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 GSTCDQ8NEC7 633 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 FEZF2Q8TBJ5 459 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 NCAPGQ9BPX3 1015 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCB6Q9NP58 842 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 ALG6Q9Y672 507 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 CARNS1A5YM72 827 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 B3GAT3O94766 335 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 POMCP01189 267 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 CLCNKBP51801 687 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 TLE2Q04725 743 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 MBTPS1Q14703 1052 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 HES6Q96HZ4 224 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 CARD9Q9H257 536 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 CXCL16Q9H2A7 254 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 TSPAN16Q9UKR8 245 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 L1RE1Q9UN81 338 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 EFCAB14O75071 495 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 CALCAP01258 141 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 CXCL10P02778 98 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP2R5EQ16537 467 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAAF5Q86Y56 855 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 RABGGTAQ92696 567 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 CAPZA3Q96KX2 299 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 TWNKQ96RR1 684 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 CDH9Q9ULB4 789 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 COG5Q9UP83 839 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 CASTOR2A6NHX0 329 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 ENPP3O14638 875 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 SPTLC1O15269 473 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 NBNO60934 754 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 TADA3O75528 432 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 CLTBP09497 229 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 BST2Q10589 180 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 PDCLQ13371 301 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 MAMLD1Q13495 774 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM60Q495X7 471 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 ODF2Q5BJF6 829 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 SEL1L2Q5TEA6 688 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD52Q8NB46 1076 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 HMGXB4Q9UGU5 601 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 MYH10P35580 1976 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 NCK2O43639 380 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 PROSCO94903 275 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 TYMPP19971 482 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 CTNNA2P26232 953 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 GABRB2P47870 512 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 FAAP100Q0VG06 881 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 PTP4A2Q12974 167 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 IKBKEQ14164 716 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 MAIP1Q8WWC4 291 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 COLEC11Q9BWP8 271 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 MIOSQ9NXC5 875 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 SZT2Q5T011 3432 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP104O60308 925 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP11A1P05108 521 aa23.9■■□□□ 1.42
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