RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590694.5

NEDD4L-231, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 165 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	IQCD	Q96DY2	449 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	SNX22	Q96L94	193 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	TIAM1	Q13009	1591 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	NWD1	Q149M9	1564 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	DRGX	A6NNA5	263 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	MYO1C	O00159	1063 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	HK1	P19367	917 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	FGFR2	P21802	821 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	KLRC1	P26715	233 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	CHN2	P52757	468 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	UCP3	P55916	312 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	C4orf46	Q504U0	113 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC15A4	Q8N697	577 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMX2	Q9Y320	296 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	CEP83	Q9Y592	693 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM233	B4DJY2	109 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694		E9PLN8	166 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	ADAMTS3	O15072	1205 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	THAP12	O43422	761 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	FOXS1	O43638	330 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	NBN	O60934	754 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	PRSS23	O95084	383 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	PLAT	P00750	562 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	MT-ND5	P03915	603 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	TEC	P42680	631 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	HSPA7	P48741	367 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	PTTG1IP	P53801	180 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLFN5	Q08AF3	891 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	TCF15	Q12870	199 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	TRIM14	Q14142	442 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	UNC13D	Q70J99	1090 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	BEND5	Q7L4P6	421 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	PDPR	Q8NCN5	879 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR56A3	Q8NH54	315 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	MIEF2	Q96C03	454 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	ADAMTS20	P59510	1910 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	PIK3R4	Q99570	1358 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694		A0A087WV62	115 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	DBX1	A6NMT0	343 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	KIF20A	O95235	890 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	CKB	P12277	381 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	IL1R1	P14778	569 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	TYRP1	P17643	537 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	BMP7	P18075	431 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	GCSH	P23434	173 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	HAL	P42357	657 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	HHEX	Q03014	270 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	IDI1	Q13907	227 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	STARD3	Q14849	445 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	MPEG1	Q2M385	716 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	BRINP3	Q76B58	766 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	RNF44	Q7L0R7	432 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	SYT12	Q8IV01	421 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	FANCB	Q8NB91	859 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
NEDD4L-231	ENST00000590694	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms