RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 ALX3O95076 343 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 GGPS1O95749 300 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 TIMP1P01033 207 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CD4P01730 458 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 GSNP06396 782 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PSMC6P62333 389 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ACAP2Q15057 778 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CLUL1Q15846 466 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE2SQ16763 222 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 HYIQ5T013 277 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 IL31RAQ8NI17 732 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 BICD2Q8TD16 824 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 JADE3Q92613 823 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 BADQ92934 168 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PHKBQ93100 1093 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SPATA33Q96N06 139 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ACAP3Q96P50 834 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 BOCQ9BWV1 1114 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-216ENST00000590105 ESYT2A0FGR8 921 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 A6NNZ2 444 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 H3BML4 177 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CDKL5O76039 1030 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 DEXIO95424 95 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 MMP3P08254 477 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 NLRP5P59047 1200 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 SEMA5AQ13591 1074 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 DPY19L1Q2PZI1 675 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM126BQ8IXS8 530 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 PPTC7Q8NI37 304 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 SKA1Q96BD8 255 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 TRPV6Q9H1D0 765 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 BCAS3Q9H6U6 928 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 TPCN1Q9ULQ1 816 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 HTTP42858 3142 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 LCTP09848 1927 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ARNTLO00327 626 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 MEIS1O00470 390 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 DLL1O00548 723 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP9AO75110 1047 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 TUSC2O75896 110 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CYP3A4P08684 503 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ADH5P11766 374 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 XBP1P17861 261 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ITGB5P18084 799 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 DNM2P50570 870 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 USP11P51784 963 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 LRP8Q14114 963 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF174Q15697 407 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CRY1Q16526 586 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CEP55Q53EZ4 464 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 GALNT17Q6IS24 598 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 MFSD5Q6N075 450 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 LILRA6Q6PI73 481 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 METTL7BQ6UX53 244 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 KRT78Q8N1N4 520 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM199Q8N511 208 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 PDILTQ8N807 584 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM156AQ8NDB6 213 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC148Q8NFR7 591 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 SEPT1Q8WYJ6 367 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 KAT2BQ92831 832 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms