RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0U1RQJ8 604 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 KPNA7A9QM74 516 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 F8VZ95 297 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CYB561D2O14569 222 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 INPPL1O15357 1258 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 P4HA2O15460 535 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP26A1O43174 497 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 OIP5O43482 229 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 MFAP3LO75121 409 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 BAIAP3O94812 1187 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 GJB5O95377 273 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TPM3P06753 285 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 GALTP07902 379 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PFKMP08237 780 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PDGFRBP09619 1106 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4Q2P0C623 313 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00271P0C7V0 271 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP3A5P20815 502 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 LMO2P25791 158 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT9P35527 623 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TAF6P49848 677 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 AP3M2P53677 418 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 LILRA4P59901 499 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TNNC1P63316 161 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CBLBQ13191 982 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SOWAHAQ2M3V2 549 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 RASIP1Q5U651 963 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TAF3Q5VWG9 929 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 DPH6Q7L8W6 267 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 USP37Q86T82 979 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP57Q86XR8 500 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC43Q8N309 656 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 UBR7Q8N806 425 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ATRIPQ8WXE1 791 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SENP8Q96LD8 212 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CHP1Q99653 195 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ELOVL4Q9GZR5 314 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP72Q9P209 647 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TFR2Q9UP52 801 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 VWA8A3KMH1 1905 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC01553A4QN01 128 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 RFXAPO00287 272 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 C2CD2LO14523 706 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PMM2O15305 246 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAM12O43184 909 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TADA2AO75478 443 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CA3P07451 260 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC130P13994 396 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SOX5P35711 763 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP2K3P46734 347 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 NDST1P52848 882 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ARPP19P56211 112 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 JAM2P57087 298 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ENPEPQ07075 957 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 CETN1Q12798 172 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ASIC2Q16515 512 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SV2CQ496J9 727 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR59Q6PJI9 974 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM270Q6UE05 265 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 ACOT1Q86TX2 421 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-208ENST00000589162 PASD1Q8IV76 773 aa6.44□□□□□ -1.38
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