RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 BCKDHBP21953 392 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 SEC13P55735 322 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 MAPK7Q13164 816 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 MTF1Q14872 753 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 ME3Q16798 604 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 TRIM61Q5EBN2 209 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 KRT79Q5XKE5 535 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 TRPC7Q9HCX4 862 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 DSEQ9UL01 958 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 TBX20Q9UMR3 447 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 MSRB2Q9Y3D2 182 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 ASPMQ8IZT6 3477 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 SEC24BO95487 1268 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 LIG4P49917 911 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 NR1H3Q13133 447 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 C2orf27AQ580R0 203 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 ARMCX6Q7L4S7 300 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 SPPL2BQ8TCT7 592 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP2A3Q93084 1043 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 F11P03951 625 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 MAPTP10636 758 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 PLS3P13797 630 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 KYAT1Q16773 422 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 C1orf186Q6ZWK4 172 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 MON1AQ86VX9 555 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 TIPINQ9BVW5 301 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 WNT6Q9Y6F9 365 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 AKAP13Q12802 2813 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 CYB561D2O14569 222 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 PAX3P23760 479 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 SMARCB1Q12824 385 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 PDIA5Q14554 519 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 SPATA1Q5VX52 437 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 C9orf57Q5W0N0 161 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 JADE1Q6IE81 842 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 LPCAT2Q7L5N7 544 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM150AQ86TG1 271 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC33Q8N5R6 958 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 STKLD1Q8NE28 680 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 RIN3Q8TB24 985 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 OSCP1Q8WVF1 389 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 HAPLN2Q9GZV7 340 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
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CAPNS1-205ENST00000588780 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
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CAPNS1-205ENST00000588780 ALDH1A2O94788 518 aa23.52■■□□□ 1.36
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CAPNS1-205ENST00000588780 HDDC3Q8N4P3 179 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 C8orf76Q96K31 380 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 SPACA7Q96KW9 195 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 TSPAN18Q96SJ8 248 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
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CAPNS1-205ENST00000588780 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 CYP11A1P05108 521 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 CFIP05156 583 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 CSH1P0DML2 217 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 CSH2P0DML3 217 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 NBR1Q14596 966 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM132DQ14C87 1099 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 SDHAF4Q5VUM1 108 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 C19orf48Q6RUI8 117 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 LRRTM3Q86VH5 581 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 PI4K2AQ9BTU6 479 aa23.51■■□□□ 1.35
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CAPNS1-205ENST00000588780 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 H0YCG3 227 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 TAF4O00268 1085 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 OGTO15294 1046 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 USP17L7P0C7H9 530 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 ENGP17813 658 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 GUCY2CP25092 1073 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 CDC25AP30304 524 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 GPR15P49685 360 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEFF1Q8IYR6 380 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 MDGA1Q8NFP4 955 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 USP33Q8TEY7 942 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 RLN3Q8WXF3 142 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-205ENST00000588780 CACNA1EQ15878 2313 aa23.49■■□□□ 1.35
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