RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 GPD2P43304 727 aa30.1■■■□□ 2.41
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
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CTDNEP1-210ENST00000574322 STARD7Q9NQZ5 370 aa30.1■■■□□ 2.41
CTDNEP1-210ENST00000574322 SQORQ9Y6N5 450 aa30.1■■■□□ 2.41
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CAND2O75155 1236 aa30.09■■■□□ 2.41
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CTDNEP1-210ENST00000574322 IFT20Q8IY31 132 aa30.08■■■□□ 2.41
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF623O75123 536 aa30.08■■■□□ 2.41
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CTDNEP1-210ENST00000574322 RNF19AQ9NV58 838 aa30.05■■■□□ 2.4
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CTDNEP1-210ENST00000574322 COL6A1P12109 1028 aa30.05■■■□□ 2.4
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CTDNEP1-210ENST00000574322 XYLT1Q86Y38 959 aa30.05■■■□□ 2.4
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CTDNEP1-210ENST00000574322 LILRA4P59901 499 aa30.04■■■□□ 2.4
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP30.04■■■□□ 2.43e-10■■■■■ 88.3
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MIS12Q9H081 205 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-210ENST00000574322 GJB6O95452 261 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-210ENST00000574322 PAK2Q13177 524 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-210ENST00000574322 TOP6BLQ8N6T0 577 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZFP42Q96MM3 310 aa30.03■■■□□ 2.4
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