RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572083.5

CCDC40-206, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC40, Length 816 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-206ENST00000572083 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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CCDC40-206ENST00000572083 AMPD2Q01433 879 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC40-206ENST00000572083 FOXC1Q12948 553 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC40-206ENST00000572083 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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CCDC40-206ENST00000572083 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.45■■□□□ 1.02
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CCDC40-206ENST00000572083 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa21.45■■□□□ 1.02
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CCDC40-206ENST00000572083 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.44■■□□□ 1.02
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CCDC40-206ENST00000572083 PAX3P23760 479 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC40-206ENST00000572083 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
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CCDC40-206ENST00000572083 WSCD1Q658N2 575 aa21.44■■□□□ 1.02
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CCDC40-206ENST00000572083 CD302Q8IX05 232 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC40-206ENST00000572083 REEP2Q9BRK0 252 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC40-206ENST00000572083 INVSQ9Y283 1065 aa21.44■■□□□ 1.02
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CCDC40-206ENST00000572083 ACOT2P49753 483 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC40-206ENST00000572083 TAF6P49848 677 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC40-206ENST00000572083 PSMD2Q13200 908 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC40-206ENST00000572083 FBXO43Q4G163 708 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC40-206ENST00000572083 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC40-206ENST00000572083 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.43■■□□□ 1.02
CCDC40-206ENST00000572083 CPA6Q8N4T0 437 aa21.43■■□□□ 1.02
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CCDC40-206ENST00000572083 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.42■■□□□ 1.02
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CCDC40-206ENST00000572083 MTF1Q14872 753 aa21.42■■□□□ 1.02
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CCDC40-206ENST00000572083 ECT2Q9H8V3 914 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC40-206ENST00000572083 TRPC7Q9HCX4 862 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC40-206ENST00000572083 EBF1Q9UH73 591 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC40-206ENST00000572083 ODF2LQ9ULJ1 636 aa21.42■■□□□ 1.02
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CCDC40-206ENST00000572083 GPBP1Q86WP2 473 aa21.41■■□□□ 1.02
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CCDC40-206ENST00000572083 WASF3Q9UPY6 502 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC40-206ENST00000572083 WNT6Q9Y6F9 365 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC40-206ENST00000572083 NUP205Q92621 2012 aa21.4■■□□□ 1.02
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CCDC40-206ENST00000572083 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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CCDC40-206ENST00000572083 ANKRD63C9JTQ0 380 aa21.39■■□□□ 1.01
CCDC40-206ENST00000572083 CSH1P0DML2 217 aa21.39■■□□□ 1.01
CCDC40-206ENST00000572083 CSH2P0DML3 217 aa21.39■■□□□ 1.01
CCDC40-206ENST00000572083 IFNAR2P48551 515 aa21.39■■□□□ 1.01
CCDC40-206ENST00000572083 TSPY1Q01534 308 aa21.39■■□□□ 1.01
CCDC40-206ENST00000572083 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.39■■□□□ 1.01
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