RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559257.5

USP3-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene USP3, Length 2,217 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-211ENST00000559257 HOXA2O43364 376 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 PEX1O43933 1283 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 PRDX6P30041 224 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 RGS7P49802 495 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 SLC26A2P50443 739 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 CASP5P51878 434 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 IRX4P78413 519 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 PPARDQ03181 441 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 LRRC63Q05C16 580 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 SEMA3AQ14563 771 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 SLC39A14Q15043 492 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 CYP2A13Q16696 494 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 MMEL1Q495T6 779 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 MFSD5Q6N075 450 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 APOA5Q6Q788 366 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 DTX3Q8N9I9 347 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 ENKURQ8TC29 256 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 MAP6Q96JE9 813 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 ACAT2Q9BWD1 397 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 GON7Q9BXV9 100 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 BRD9Q9H8M2 597 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 CAPN11Q9UMQ6 739 aa8.85□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 A0A1W2PQC6 194 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 A0A1W2PRQ8 180 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 FAM196BA6NMK8 535 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 H3BSA7 217 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 PSMD11O00231 422 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 ST8SIA5O15466 376 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 NUAK1O60285 661 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 DNAJC6O75061 913 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 ADAM11O75078 769 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 FGAP02671 866 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 C8BP07358 591 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 ICAM2P13598 275 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 PPP1R2P41236 205 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 PRKCIP41743 596 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 SLC5A3P53794 718 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 CYP4F2P78329 520 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 PHC1P78364 1004 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 RHAGQ02094 409 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 ENPEPQ07075 957 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 CYP4F3Q08477 520 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 CDC20Q12834 499 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 STK3Q13188 491 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 PPP2R5EQ16537 467 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 KRT24Q2M2I5 525 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 C12orf60Q5U649 245 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 WDR59Q6PJI9 974 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 RANBP10Q6VN20 620 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 SEPT1Q8WYJ6 367 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 MEIS3Q99687 375 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 TLR10Q9BXR5 811 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 SDHAF3Q9NRP4 125 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 VPS45Q9NRW7 570 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 VPS4AQ9UN37 437 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 MAPRE3Q9UPY8 281 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 CPDO75976 1380 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 PI15O43692 258 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 MAGEC1O60732 1142 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 MYO1DO94832 1006 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 IFNA14P01570 189 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 HSPA6P17066 643 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 PON1P27169 355 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 MTHFRP42898 656 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 ALDH3B2P48448 385 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 HSPA13P48723 471 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 POU6F1Q14863 301 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 ACAP2Q15057 778 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 DUSP7Q16829 419 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 C5orf22Q49AR2 442 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 CAVIN4Q5BKX8 364 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 CDH26Q8IXH8 852 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 FBXL6Q8N531 539 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 TTC13Q8NBP0 860 aa8.84□□□□□ -0.99
USP3-211ENST00000559257 RFWD2Q8NHY2 731 aa8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms