RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559060.5

JDP2-206, Transcript of Jun dimerization protein 2, human

TSL 3

Gene JDP2, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JDP2-206	ENST00000559060	SNX21	Q969T3	373 aa		27.58	■■■□□ 2.01
JDP2-206	ENST00000559060	SAAL1	Q96ER3	474 aa		27.58	■■■□□ 2.01
JDP2-206	ENST00000559060	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		27.58	■■■□□ 2.01
JDP2-206	ENST00000559060	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
JDP2-206	ENST00000559060	SPTBN2	O15020	2390 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	IDE	P14735	1019 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	CNR2	P34972	360 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	CASP5	P51878	434 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	ALCAM	Q13740	583 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	STKLD1	Q8NE28	680 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	CHFR	Q96EP1	664 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	FAM84A	Q96KN4	292 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	ZNF560	Q96MR9	790 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	ACCS	Q96QU6	501 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	GCNT3	O95395	438 aa		27.56	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	ITGB3	P05106	788 aa		27.56	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	HOXA6	P31267	233 aa		27.56	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	PNPLA4	P41247	253 aa		27.56	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		27.56	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	HPS4	Q9NQG7	708 aa		27.56	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	L1RE1	Q9UN81	338 aa		27.56	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		27.55	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	AVPR1A	P37288	418 aa		27.55	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	TSPY1	Q01534	308 aa		27.55	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		27.55	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	TXNDC8	Q6A555	127 aa		27.55	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		27.55	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	HSCB	Q8IWL3	235 aa		27.55	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		27.55	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	RIN3	Q8TB24	985 aa		27.55	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	RTKN	Q9BST9	563 aa		27.55	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	PANK2	Q9BZ23	570 aa		27.55	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	SPTLC2	O15270	562 aa		27.54	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	EXTL3	O43909	919 aa		27.54	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	LRP3	O75074	770 aa		27.54	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	RUNX3	Q13761	415 aa		27.54	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		27.54	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	PDILT	Q8N807	584 aa		27.54	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	PKMYT1	Q99640	499 aa		27.54	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	ACBD6	Q9BR61	282 aa		27.54	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		27.54	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		27.54	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	TDP1	Q9NUW8	608 aa		27.54	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		27.53	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		27.53	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		27.53	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	PPP6R2	O75170	966 aa		27.53	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	GART	P22102	1010 aa		27.53	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	27.53	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	DDR2	Q16832	855 aa		27.53	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		27.53	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		27.53	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		27.53	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		27.53	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		27.53	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	EBF3	Q9H4W6	596 aa		27.53	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	PANK4	Q9NVE7	773 aa		27.53	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060		A0A087X0B3	334 aa		27.52	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	YEATS4	O95619	227 aa		27.52	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	CSH1	P0DML2	217 aa		27.52	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	CSH2	P0DML3	217 aa		27.52	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	CYP2F1	P24903	491 aa		27.52	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	CCDC142	Q17RM4	750 aa		27.52	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		27.52	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		27.52	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	MON1A	Q86VX9	555 aa		27.52	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		27.52	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	OSTM1	Q86WC4	334 aa		27.52	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		27.52	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	TNMD	Q9H2S6	317 aa		27.52	■■■□□ 2
JDP2-206	ENST00000559060	CUEDC2	Q9H467	287 aa		27.52	■■■□□ 2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms