RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555540.1

KRT18P6-201, Transcript of keratin 18 pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene KRT18P6, Length 1,265 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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KRT18P6-201ENST00000555540 CASP5P51878 434 aa21.89■■□□□ 1.09
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KRT18P6-201ENST00000555540 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.89■■□□□ 1.09
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