RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 KRT87PA6NCN2 255 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 DBX1A6NMT0 343 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 AGAP14A8MT82 685 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 H3BNC9 293 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 FCHO1O14526 889 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 ZBTB43O43298 467 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 SIGLEC6O43699 453 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 NOL3O60936 208 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 TBX10O75333 385 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 SEC22BO75396 215 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 GJB3O75712 270 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PIAS2O75928 621 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 SNX4O95219 450 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 NDST3O95803 873 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 CLEC3BP05452 202 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 TYRP14679 529 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 IL4RP24394 825 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 NOS3P29474 1203 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 AKT1P31749 480 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 GRK5P34947 590 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 TKTL1P51854 596 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PRKAA2P54646 552 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 RPS16P62249 146 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 KLHL30Q0D2K2 578 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 COASYQ13057 564 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 RABEP1Q15276 862 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 SEC23BQ15437 767 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 OASLQ15646 514 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 BMP2KLQ5H9B9 411 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 SFRP5Q5T4F7 317 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 DEPDC1Q5TB30 811 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 EEF1DP3Q658K8 133 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 CPZQ66K79 652 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 WDR73Q6P4I2 378 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 CYP20A1Q6UW02 462 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PET117Q6UWS5 81 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 BEND4Q6ZU67 534 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 METTL23Q86XA0 190 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 ULK2Q8IYT8 1036 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 NLGN4XQ8N0W4 816 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 USP38Q8NB14 1042 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 GLIS1Q8NBF1 620 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 AGBL5Q8NDL9 886 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 DNAJB8Q8NHS0 232 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 KCNG4Q8TDN1 519 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 GRK7Q8WTQ7 553 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 ZFAND2BQ8WV99 257 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 MAML1Q92585 1016 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 KRT35Q92764 455 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 DPF2Q92785 391 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PTP4A1Q93096 173 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 CDCA5Q96FF9 252 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 LRRC46Q96FV0 321 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 MEGF10Q96KG7 1140 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 SNX27Q96L92 541 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 TMEM237Q96Q45 408 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 GDF15Q99988 308 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 REEP2Q9BRK0 252 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 TEX13BQ9BXU2 312 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 TWSG1Q9GZX9 223 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 SEMA4AQ9H3S1 761 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PDE7BQ9NP56 450 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 KCNH7Q9NS40 1196 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 MCM9Q9NXL9 1143 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 CLDND1Q9NY35 253 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 STK32BQ9NY57 414 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 TAB2Q9NYJ8 693 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 RGL1Q9NZL6 768 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 ANAPC5Q9UJX4 755 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PSAT1Q9Y617 370 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa3.82□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 ARHGAP10A1A4S6 786 aa3.82□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 C2orf81A6NN90 581 aa3.82□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 WDR46O15213 610 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 DHX15O43143 795 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 ASAP2O43150 1006 aa3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms