RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF446Q9NWS9 450 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PXDNQ92626 1479 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 GAKO14976 1311 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FYNP06241 537 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 CDH3P22223 829 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ETV3P41162 512 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 OXCT1P55809 520 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ST8SIA6P61647 398 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FOXK2Q01167 660 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.59□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 AKT1S1Q96B36 256 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ZFYVE19Q96K21 471 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 RIT2Q99578 217 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 IDI2Q9BXS1 227 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MARCH7Q9H992 704 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GIN1Q9NXP7 522 aa6.59□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 ACAD8Q9UKU7 415 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 VPS4AQ9UN37 437 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NMT2O60551 498 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PPP6R2O75170 966 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MAP3K6O95382 1288 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFB10O96000 172 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 MAPK9P45984 424 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CYP2J2P51589 502 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF827Q17R98 1081 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PACS1Q6VY07 963 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 WNK4Q96J92 1243 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 USP18Q9UMW8 372 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 C2orf74A8MZ97 194 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FOXN1O15353 648 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SSX5O60225 188 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ACSL4O60488 711 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 IL18RAPO95256 599 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 PDHBP11177 359 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 STX5Q13190 355 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 DYMQ7RTS9 669 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 PHF21AQ96BD5 680 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 SOX13Q9UN79 622 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 KCNJ14Q9UNX9 436 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 EMSYQ7Z589 1322 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 DTNBO60941 627 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 AKR1B1P15121 316 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CCT8P50990 548 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 HERVK_113P62684 666 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CYP4A22Q5TCH4 519 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
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