RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 DNPEPQ9ULA0 475 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF839A8K0R7 811 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 BNIP3LO60238 219 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 PAEPP09466 180 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 POU5F1BQ06416 359 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 HIC1Q14526 733 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 PLA2G4FQ68DD2 849 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 RRM2BQ7LG56 351 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 SPATA21Q7Z572 469 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 ATP8B4Q8TF62 1192 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM169Q96HH4 297 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 DCLK3Q9C098 648 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 SIK2Q9H0K1 926 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 TRPC7Q9HCX4 862 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 ABCC6O95255 1503 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 KANSL1LA0AUZ9 987 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 PI4K2BG5E9Z4 385 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 URODP06132 367 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 GCKP35557 465 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 RANBP1P43487 201 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 TP53BP2Q13625 1128 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 IL31Q6EBC2 164 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 ELMO2Q96JJ3 720 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 COG4Q9H9E3 785 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 AIPL1Q9NZN9 384 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 HPS5Q9UPZ3 1129 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 FAM47DPA6NHR8 397 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 SYCE1LA8MT33 242 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 HACD1B0YJ81 288 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 M0R3G1 203 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 CYP2B6P20813 491 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 NFIAQ12857 509 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 IQSEC1Q6DN90 963 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 USP38Q8NB14 1042 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 ICA1LQ8NDH6 482 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF555Q8NEP9 628 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 ING2Q9H160 280 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 CASS4Q9NQ75 786 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 PLA2G6O60733 806 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 GLRA3O75311 464 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 ZMYND10O75800 440 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 KRT4P19013 534 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 CYP2C18P33260 490 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 GRB10Q13322 594 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 GNASQ5JWF2 1037 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 BTNL9Q6UXG8 535 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 UMODL1Q5DID0 1318 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 FAM107AO95990 144 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 FAM83EQ2M2I3 478 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 AGAP9Q5VTM2 703 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 CHSY1Q86X52 802 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 AGXT2Q9BYV1 514 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 STK25O00506 426 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 OPLAHO14841 1288 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 CRTAMO95727 393 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 ACOT2P49753 483 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 SERPINB8P50452 374 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 DDIASQ8IXT1 998 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 EPN3Q9H201 632 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 RAD54BQ9Y620 910 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 WDR91A4D1P6 747 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRB-208ENST00000550358 SRGAP2O75044 1071 aa8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms