RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 APBB2Q92870 758 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 FAR2Q96K12 515 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NAGPAQ9UK23 515 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MYMKA6NI61 221 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MYBP10242 640 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 KCNA4P22459 653 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 STIP1P31948 543 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ITPK1Q13572 414 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 HPS3Q969F9 1004 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CD274Q9NZQ7 290 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 GSNP06396 782 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 IRF1P10914 325 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TGM3Q08188 693 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CUL2Q13617 745 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CATSPER3Q86XQ3 398 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 VIPAS39Q9H9C1 493 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 GRID1Q9ULK0 1009 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TBC1D4O60343 1298 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 VDRP11473 427 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ITGA9Q13797 1035 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MYBPC2Q14324 1141 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SNX31Q8N9S9 440 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TMX2Q9Y320 296 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MROH7Q68CQ1 1323 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RASSF10A6NK89 507 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 BMP10O95393 424 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ALDH2P05091 517 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ITGB3P05106 788 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ACADMP11310 421 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CYP11B2P19099 503 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PDIA6Q15084 440 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 HINFPQ9BQA5 517 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SOAT2O75908 522 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 FNTAP49354 379 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 GEMP55040 296 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM65Q6PJ69 517 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 FBXO32Q969P5 355 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 APPL1Q9UKG1 709 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 EVPLLA8MZ36 301 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF410Q86VK4 478 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SGSM3Q96HU1 749 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 HES6Q96HZ4 224 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PP2D1A8MPX8 630 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SUPT3HB4E1H0 165 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 GRK3P35626 688 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PPP3CCP48454 512 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RENBPP51606 427 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 HIC1Q14526 733 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CHSY1Q86X52 802 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 WDR49Q8IV35 697 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 OSBPL8Q9BZF1 889 aa6.66□□□□□ -1.34
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