RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 MTMR11A4FU01 709 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CLIC2O15247 247 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TACC1O75410 805 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 NR3C1P04150 777 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 MYL4P12829 197 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 PFKLP17858 780 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SDHBP21912 280 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 NR2F2P24468 414 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 EHHADHQ08426 723 aa6□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF699Q32M78 642 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR72Q3MJ13 1102 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CFAP221Q4G0U5 840 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 WSCD1Q658N2 575 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CENPPQ6IPU0 288 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CBWD2Q8IUF1 395 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC44A3Q8N4M1 653 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM105Q8N8V8 129 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf127Q8N9H9 656 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 STKLD1Q8NE28 680 aa6□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC15Q8TF66 581 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 PSMG2Q969U7 264 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 MKNK1Q9BUB5 465 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 KIF9Q9HAQ2 790 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 OBP2AQ9NY56 170 aa6□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 CHMP5Q9NZZ3 219 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 YIPF1Q9Y548 306 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF263O14978 683 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAM12O43184 909 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TGFB1I1O43294 461 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 GNA14O95837 355 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 PSMC3P17980 439 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 WARSP23381 471 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 WEE1P30291 646 aa5.99□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 MAGEA11P43364 429 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 VAMP7P51809 220 aa5.99□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 UBE2HP62256 183 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA8FQ08AF8 430 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 DPYDQ12882 1025 aa5.99□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 NCOA4Q13772 614 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 COBLL1Q53SF7 1204 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 NUDT18Q6ZVK8 323 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TADA2BQ86TJ2 420 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 EFCAB13Q8IY85 973 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM186BQ8IYM0 893 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA2013Q8IYS2 634 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SIX5Q8N196 739 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 PDCL2Q8N4E4 241 aa5.99□□□□□ -1.45
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