RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544497.1

DDX47-211, Transcript of DEAD-box helicase 47, humanhuman

TSL 2

Gene DDX47, Length 628 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX47-211ENST00000544497 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 POGKQ9P215 609 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 CPNE7Q9UBL6 633 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 POM121BA6NF01 834 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 MROH6A6NGR9 719 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 ISM1B1AKI9 464 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 MYO1FO00160 1098 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 TBX3O15119 743 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 B4GALT4O60513 344 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 GNAI3P08754 354 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 ATP5JP18859 108 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 STT3AP46977 705 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 SOX8P57073 446 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 GNAI1P63096 354 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 ADAM8P78325 824 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 NFYCQ13952 458 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 FAM47AQ5JRC9 791 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 ANO1Q5XXA6 986 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 FAM124AQ86V42 546 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 TTC9BQ8N6N2 239 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 POF1BQ8WVV4 589 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 RABGGTAQ92696 567 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 MBD6Q96DN6 1003 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 SUCLG2Q96I99 432 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 MYOCQ99972 504 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 SELENOOQ9BVL4 669 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 VPS11Q9H270 941 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 SACM1LQ9NTJ5 587 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX47-211ENST00000544497 UBE2QL1A1L167 161 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 SLC26A4O43511 780 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 NCK2O43639 380 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 HDCP19113 662 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 PHKA1P46020 1223 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 FMO1Q01740 532 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 ZNF543Q08ER8 600 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 FAM209BQ5JX69 171 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 MRGPRX1Q96LB2 322 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 MRI1Q9BV20 369 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 STARD7Q9NQZ5 370 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 PIK3C2AO00443 1686 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 A0A1W2PRX2 142 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 SBK3P0C264 359 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 ABCB4P21439 1286 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 RAC3P60763 192 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 RAP2BP61225 183 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 NOMO3P69849 1222 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 RIN1Q13671 783 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 CCDC93Q567U6 631 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 ERAP2Q6P179 960 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 ZNF529Q6P280 563 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 SESTD1Q86VW0 696 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 SHCBP1Q8NEM2 672 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 OR6B3Q8NGW1 331 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 KIAA1191Q96A73 305 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 TCF25Q9BQ70 676 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 SRRDQ9UH36 339 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 SLIT3O75094 1523 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 IL18RAPO95256 599 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 EN2P19622 333 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 PRELPP51888 382 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 KIAA2012Q0VF49 1180 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 DAG1Q14118 895 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 TRIM14Q14142 442 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 FAM214AQ32MH5 1076 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 DACT2Q5SW24 774 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 IZUMO3Q5VZ72 239 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 ZNF783Q6ZMS7 281 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX47-211ENST00000544497 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms