RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SUDS3-204ENST00000543473 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SUDS3-204ENST00000543473 SH3GL2Q99962 352 aa20.19■□□□□ 0.82
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SUDS3-204ENST00000543473 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.19■□□□□ 0.82
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SUDS3-204ENST00000543473 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
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SUDS3-204ENST00000543473 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.19■□□□□ 0.82
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SUDS3-204ENST00000543473 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.16■□□□□ 0.82
SUDS3-204ENST00000543473 EXD1Q8NHP7 514 aa20.16■□□□□ 0.82
SUDS3-204ENST00000543473 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.16■□□□□ 0.82
SUDS3-204ENST00000543473 MAGEB5Q9BZ81 275 aa20.16■□□□□ 0.82
SUDS3-204ENST00000543473 VPS33BQ9H267 617 aa20.16■□□□□ 0.82
SUDS3-204ENST00000543473 H0Y626 953 aa20.16■□□□□ 0.82
SUDS3-204ENST00000543473 KLRC4O43908 158 aa20.16■□□□□ 0.82
SUDS3-204ENST00000543473 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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