RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528478.1

SBF2-208, Transcript of SET binding factor 2, human

TSL 4

Gene SBF2, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF2-208	ENST00000528478	SCRN1	Q12765	414 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	GALE	Q14376	348 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TTLL4	Q14679	1199 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RAB30	Q15771	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	COPS5	Q92905	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	VWCE	Q96DN2	955 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TMEM169	Q96HH4	297 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FBXL18	Q96ME1	805 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TBCB	Q99426	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CEP41	Q9BYV8	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	VPS11	Q9H270	941 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478		J3KRW8	73 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PLA2G6	O60733	806 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	HIP1R	O75146	1068 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TUSC2	O75896	110 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	MBD3	O95983	291 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ICAM1	P05362	532 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CKM	P06732	381 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	GPR3	P46089	330 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	NOV	P48745	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SEPHS1	P49903	392 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SLC16A1	P53985	500 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	HAND2	P61296	217 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	NUCB1	Q02818	461 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TFF2	Q03403	129 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	KRT40	Q6A162	431 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	LILRA6	Q6PI73	481 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	KSR1	Q8IVT5	923 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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