RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	ELMOD1	Q8N336	334 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	SMARCE1	Q969G3	411 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	PSMG2	Q969U7	264 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	MYLPF	Q96A32	169 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	MMS19	Q96T76	1030 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	SYT15	Q9BQS2	421 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	IL21	Q9HBE4	155 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	ASAH2	Q9NR71	780 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	CA14	Q9ULX7	337 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	MAFF	Q9ULX9	164 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	SRF	P11831	508 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	GABRR2	P28476	465 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	VIPR2	P41587	438 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	LHX1	P48742	406 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	VAMP7	P51809	220 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	CACNA2D1	P54289	1103 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	EPHB3	P54753	998 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	MYL7	Q01449	175 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	TSPY1	Q01534	308 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	ADAM9	Q13443	819 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	TRPC3	Q13507	836 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	NCOA4	Q13772	614 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	GRM2	Q14416	872 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF699	Q32M78	642 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	IQCE	Q6IPM2	695 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	DPH6	Q7L8W6	267 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	ADSSL1	Q8N142	457 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	SIX5	Q8N196	739 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	FBXL6	Q8N531	539 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	TMC2	Q8TDI7	906 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	ASB16	Q96NS5	453 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	GSDMA	Q96QA5	445 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	BIN1	O00499	593 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	CLDN5	O00501	218 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	MAPK13	O15264	365 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	PI15	O43692	258 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	PHACTR2	O75167	634 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	TACC1	O75410	805 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	TADA3	O75528	432 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	KIF20A	O95235	890 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	HLA-DRA	P01903	254 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	BDNF	P23560	247 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	GCLM	P48507	274 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	TNNC1	P63316	161 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	ORC1	Q13415	861 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	VIT	Q6UXI7	678 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	MTSS1L	Q765P7	747 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	PRSS33	Q8NF86	280 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	SPATA18	Q8TC71	538 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	NXPE3	Q969Y0	559 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	PCED1B	Q96HM7	432 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	RMND1	Q9NWS8	449 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	GDE1	Q9NZC3	331 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	CDH9	Q9ULB4	789 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	SHISA7	A6NL88	538 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF197	O14709	1029 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	ECI2	O75521	394 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	MICAL2	O94851	1124 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	SMC2	O95347	1197 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PABPC1-222	ENST00000523555	PRAMEF12	O95522	483 aa		10.17	□□□□□ -0.78

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