RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	ALG8	Q9BVK2	526 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CDK1-208	ENST00000519760	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CDK1-208	ENST00000519760	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CDK1-208	ENST00000519760	STAP2	Q9UGK3	403 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CDK1-208	ENST00000519760	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CDK1-208	ENST00000519760	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	3.78	□□□□□ -1.8
CDK1-208	ENST00000519760	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SOAT2	O75908	522 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	PRKCG	P05129	697 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	FAM163B	P0C2L3	166 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	PF4V1	P10720	104 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SOX10	P56693	466 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SOX8	P57073	446 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	KRTAP10-11	P60412	298 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	BMPR2	Q13873	1038 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SIK2	Q9H0K1	926 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	CPA4	Q9UI42	421 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	3.77	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	TARM1	B6A8C7	271 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760		H0YIZ8	118 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	NDUFB7	P17568	137 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	AKAP5	P24588	427 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	MPG	P29372	298 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	CYP2C18	P33260	490 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF81	P51508	661 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	LONRF3	Q496Y0	759 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	TREML2	Q5T2D2	321 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ICE2	Q659A1	982 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	DTX2	Q86UW9	622 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	FAM167A	Q96KS9	214 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	NT5C1B	Q96P26	610 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	LINC01548	A6NM66	108 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SMIM22	K7EJ46	135 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	AP1G1	O43747	822 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ABLIM3	O94929	683 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	FES	P07332	822 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	GRP	P07492	148 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	MYB	P10242	640 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ENG	P17813	658 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	KCNJ5	P48544	419 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	IQCB1	Q15051	598 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	PROSER3	Q2NL68	480 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	EMC10	Q5UCC4	262 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	GLG1	Q92896	1179 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	MAP3K14	Q99558	947 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	XPR1	Q9UBH6	696 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	TISP43	B9A030	160 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ALDH1L1	O75891	902 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	LATS1	O95835	1130 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ALDH9A1	P49189	494 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	UCP3	P55916	312 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	CYP4F2	P78329	520 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	MCL1	Q07820	350 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	GRM1	Q13255	1194 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	LLGL1	Q15334	1064 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	PCID2	Q5JVF3	399 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CDK1-208	ENST00000519760	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81

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