RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 M0QZQ0 153 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 O00370 1275 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 GABRDO14764 452 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 ARHGEF15O94989 841 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 MOCS3O95396 460 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 ODC1P11926 461 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 RGS7P49802 495 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 CACNA2D1P54289 1103 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 NOMO3P69849 1222 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 KRT83P78385 493 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 TTC30AQ86WT1 665 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 TNS4Q8IZW8 715 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 SUSD3Q96L08 255 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 UROC1Q96N76 676 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 WDR24Q96S15 920 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 ZBED2Q9BTP6 218 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 C2CD2LO14523 706 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 ZSCAN12O43309 604 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 HOXA2O43364 376 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 BEST1O76090 585 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 PFKMP08237 780 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 WARSP23381 471 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 BPIFB4P59827 614 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 SGO2Q562F6 1265 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 RTP2Q5QGT7 225 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 OVOS1Q6IE37 1185 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 STKLD1Q8NE28 680 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 TRIM7Q9C029 511 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 GJB5O95377 273 aa16.46■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 PAEPP09466 180 aa16.46■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 CAPN2P17655 700 aa16.46■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 RPL17P18621 184 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16.46■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF592Q92610 1267 aa16.46■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 BTBD6Q96KE9 485 aa16.46■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 MTUS1Q9ULD2 1270 aa16.46■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 COG5Q9UP83 839 aa16.46■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa16.46■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 BAIAP3O94812 1187 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 FUT10Q6P4F1 479 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 KCNT2Q6UVM3 1135 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PAQR9Q6ZVX9 377 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 CPNE8Q86YQ8 564 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 CPXM1Q96SM3 734 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 SYT15Q9BQS2 421 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 HYOU1Q9Y4L1 999 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 NLRC5Q86WI3 1866 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 H2AFZP0C0S5 128 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 VDRP11473 427 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 ARPP19P56211 112 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 ACAD10Q6JQN1 1059 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 NYAP1Q6ZVC0 841 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 H2AFVQ71UI9 128 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 FUKQ8N0W3 1084 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PCED1BQ96HM7 432 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PGLYRP2Q96PD5 576 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 ISCUQ9H1K1 167 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 ST7Q9NRC1 585 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa16.45■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 GABBR2O75899 941 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 RRM1P23921 792 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 KIF5AQ12840 1032 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PTPN20Q4JDL3 420 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 SYT10Q6XYQ8 523 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 FAXDC2Q96IV6 333 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 KCNK16Q96T55 309 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 B3GNT5Q9BYG0 378 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 RTN2O75298 545 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00271P0C7V0 271 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 DNAJB2P25686 324 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 GPD2P43304 727 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 NSFP46459 744 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 CENPCQ03188 943 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 SHHQ15465 462 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-206ENST00000517323 PMF1Q6P1K2 205 aa16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms