RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515712.1

ACTBP2-201, Transcript of actin, beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP2, Length 1,123 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP2-201ENST00000515712 CETN3O15182 167 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 NCAM2O15394 837 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 TACC1O75410 805 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 STAU1O95793 577 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 EPB41P11171 864 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 PSMC3P17980 439 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 AOC1P19801 751 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 WARSP23381 471 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 AVPR1AP37288 418 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 PIK3CAP42336 1068 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 VAMP7P51809 220 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 GPC5P78333 572 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 CYP27A1Q02318 531 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 ADAM9Q13443 819 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 PNOCQ13519 176 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 SOWAHAQ2M3V2 549 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 CFAP221Q4G0U5 840 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 FAM78AQ5JUQ0 283 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 GPR158Q5T848 1215 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 VSTM1Q6UX27 236 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 FAM186BQ8IYM0 893 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 PARD3BQ8TEW8 1205 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 GIPC2Q8TF65 315 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 TAF4BQ92750 862 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 DNASE1L2Q92874 299 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 TNIP3Q96KP6 325 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 ASB16Q96NS5 453 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 LPIN3Q9BQK8 851 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 TBC1D17Q9HA65 648 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 GTF3C4Q9UKN8 822 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 MYO10Q9HD67 2058 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 SCN1AP35498 2009 aa11.94□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 TSC2P49815 1807 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 GABRDO14764 452 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 PSMA7O14818 248 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 TRIM66O15016 1216 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 SOAT2O75908 522 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 PDGFRBP09619 1106 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 GRIK1P39086 918 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 CCR2P41597 374 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 PDE6CP51160 858 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 VCPP55072 806 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 MYL6P60660 151 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 NFIL3Q16649 462 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 EDRF1Q3B7T1 1238 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 SLC44A4Q53GD3 710 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 C1orf228Q6PIY5 440 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 TTC9BQ8N6N2 239 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 SHKBP1Q8TBC3 707 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 CEP295NLQ96MC4 621 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 NELL2Q99435 816 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 DNAJC25Q9H1X3 360 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 CRISPLD1Q9H336 500 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 DMAC2Q9NW81 257 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 SIT1Q9Y3P8 196 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 TRIOO75962 3097 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 MUC6Q6W4X9 2439 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 MAN2B1O00754 1011 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 VNN2O95498 520 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 CST3P01034 146 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 GJA1P17302 382 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 ATF6P18850 670 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 CYP2F1P24903 491 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 GDI1P31150 447 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 MAGEA11P43364 429 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 CASP4P49662 377 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 PLCB2Q00722 1185 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 ENPEPQ07075 957 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 UBXN2BQ14CS0 331 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 TANGO2Q6ICL3 276 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 ZNF852Q6ZMS4 543 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 LRRTM3Q86VH5 581 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 TMC8Q8IU68 726 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 MFSD6LQ8IWD5 586 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 CXorf38Q8TB03 319 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 MYLPFQ96A32 169 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 MSANTD3Q96H12 275 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 FAM84AQ96KN4 292 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 MED10Q9BTT4 135 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 MKNK1Q9BUB5 465 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 BCO2Q9BYV7 579 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTBP2-201ENST00000515712 ELOVL4Q9GZR5 314 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.3 ms