RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514153.5

FAM149A-215, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, human

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene FAM149A, Length 2,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM149A-215	ENST00000514153	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
FAM149A-215	ENST00000514153	DNA2	P51530	1060 aa		32.4	■■■□□ 2.78
FAM149A-215	ENST00000514153	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		32.4	■■■□□ 2.78
FAM149A-215	ENST00000514153	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
FAM149A-215	ENST00000514153	BTBD6	Q96KE9	485 aa		32.4	■■■□□ 2.78
FAM149A-215	ENST00000514153	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
FAM149A-215	ENST00000514153	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		32.4	■■■□□ 2.78
FAM149A-215	ENST00000514153	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FAM149A-215	ENST00000514153	TRIM11	Q96F44	468 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FAM149A-215	ENST00000514153	PSMB7	Q99436	277 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FAM149A-215	ENST00000514153	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FAM149A-215	ENST00000514153	GABRD	O14764	452 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FAM149A-215	ENST00000514153	SRGAP2	O75044	1071 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FAM149A-215	ENST00000514153	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
FAM149A-215	ENST00000514153	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FAM149A-215	ENST00000514153	ERICH1	Q86X53	443 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FAM149A-215	ENST00000514153	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FAM149A-215	ENST00000514153	KIAA0355	O15063	1070 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	MYBL1	P10243	752 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	AMPD2	Q01433	879 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	GJB6	O95452	261 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	ODC1	P11926	461 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	ADORA2B	P29275	332 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	RFC2	P35250	354 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	GPD2	P43304	727 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	LIN9	Q5TKA1	542 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	TLR10	Q9BXR5	811 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	TTC30A	Q86WT1	665 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	TNIP3	Q96KP6	325 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	CPXM1	Q96SM3	734 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	TRIM7	Q9C029	511 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	PFKM	P08237	780 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	TSC2	P49815	1807 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	ACR	P10323	421 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	TCEAL1	Q15170	157 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	TULP2	O00295	520 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	HOXA2	O43364	376 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	MESD	Q14696	234 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	STIL	Q15468	1287 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	ST7	Q9NRC1	585 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	PIK3R2	O00459	728 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	CALB1	P05937	261 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	CXCR5	P32302	372 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	LHX1	P48742	406 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	PDCL	Q13371	301 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	SYNC	Q9H7C4	482 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153		M0QZQ0	153 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	MTA2	O94776	668 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	MAMLD1	Q13495	774 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	MFSD5	Q6N075	450 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	PEX26	Q7Z412	305 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	SUSD3	Q96L08	255 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	HESX1	Q9UBX0	185 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	PBX3	P40426	434 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	BCAR1	P56945	870 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	SYT15	Q9BQS2	421 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	CDC23	Q9UJX2	597 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	SNX12	Q9UMY4	172 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	ZNF185	O15231	689 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	ERBB2	P04626	1255 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	FAM163B	P0C2L3	166 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	CAPN2	P17655	700 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	RGS7	P49802	495 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	PKDCC	Q504Y2	493 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FAM149A-215	ENST00000514153	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
FAM149A-215	ENST00000514153	CLDN5	O00501	218 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FAM149A-215	ENST00000514153	NRP1	O14786	923 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FAM149A-215	ENST00000514153	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		32.32	■■■□□ 2.76

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