RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511139.1

FAM172A-209, Transcript of family with sequence similarity 172 member A, human

TSL 5

Gene FAM172A, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM172A-209	ENST00000511139	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	NBL1	P41271	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	CLCN4	P51793	760 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	ERVFC1	P60507	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	PRKCQ	Q04759	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	TUSC3	Q13454	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
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FAM172A-209	ENST00000511139	PTPA	Q15257	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	INF2	Q27J81	1249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	LIN9	Q5TKA1	542 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	TPGS2	Q68CL5	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	HDX	Q7Z353	690 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
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FAM172A-209	ENST00000511139	CD302	Q8IX05	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	ELMOD1	Q8N336	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
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FAM172A-209	ENST00000511139	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		4.87	□□□□□ -1.63
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FAM172A-209	ENST00000511139	ASIC4	Q96FT7	647 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	AK8	Q96MA6	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
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FAM172A-209	ENST00000511139	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
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FAM172A-209	ENST00000511139	STOML1	Q9UBI4	398 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	VAV3	Q9UKW4	847 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.87	□□□□□ -1.63
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FAM172A-209	ENST00000511139	NRP1	O14786	923 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	CHMP2A	O43633	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	TADA2A	O75478	443 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	STBD1	O95210	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	FGFR1	P11362	822 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	CYP11B2	P19099	503 aa		4.86	□□□□□ -1.63
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FAM172A-209	ENST00000511139	PDC	P20941	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	DNAJB1	P25685	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	ARL2	P36404	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	RARRES1	P49788	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	AMPD2	Q01433	879 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	LMNB2	Q03252	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	PLD1	Q13393	1074 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	ZNF394	Q53GI3	561 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	PPM1J	Q5JR12	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	C12orf40	Q86WS4	652 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM172A-209	ENST00000511139	HAS1	Q92839	578 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms