RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501011.6

RAB30-AS1-201, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB30-AS1, Length 607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SNX25Q9H3E2 840 aa12.96□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MFSD1Q9H3U5 465 aa12.96□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM63CQ9P1W3 806 aa12.96□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAN1B1Q9UKM7 699 aa12.96□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CA14Q9ULX7 337 aa12.96□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 VNN1O95497 513 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SRFP11831 508 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 WARSP23381 471 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CYP2F1P24903 491 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RPL13P26373 211 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PCSK1P29120 753 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RAP1GAPP47736 663 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 VCPP55072 806 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CDH8P55286 799 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NCOA4Q13772 614 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MORC3Q14149 939 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 VEPH1Q14D04 833 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF699Q32M78 642 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZCWPW2Q504Y3 356 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM78AQ5JUQ0 283 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TANGO2Q6ICL3 276 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DPH6Q7L8W6 267 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ITIH5Q86UX2 942 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SCN4BQ8IWT1 228 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SIX5Q8N196 739 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FLCNQ8NFG4 579 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OR6B3Q8NGW1 331 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SHKBP1Q8TBC3 707 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMC2Q8TDI7 906 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM174Q8WUU8 243 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SYT15Q9BQS2 421 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LRRC3Q9BY71 257 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 XYLT2Q9H1B5 865 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SMYD3Q9H7B4 428 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GDE1Q9NZC3 331 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NME7Q9Y5B8 376 aa12.95□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 BIN1O00499 593 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 STK25O00506 426 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KRT13P13646 458 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GABRR2P28476 465 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ATICP31939 592 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PIK3CAP42336 1068 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GCLMP48507 274 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 AP3M2P53677 418 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EPHA5P54756 1037 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GPC5P78333 572 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CLDN10P78369 228 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CYP27A1Q02318 531 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SMARCB1Q12824 385 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DDR2Q16832 855 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C1orf220Q5T0J3 134 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 STXBP5Q5T5C0 1151 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CCDC183Q5T5S1 534 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SV2AQ7L0J3 742 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LIMS2Q7Z4I7 341 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PIP4P2Q8N4L2 257 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRIML1Q8N9V2 468 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LEMD2Q8NC56 503 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPATA18Q8TC71 538 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PSMG2Q969U7 264 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MYLPFQ96A32 169 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PKMYT1Q99640 499 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TSG101Q99816 390 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ATXN3LQ9H3M9 355 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DPEP3Q9H4B8 488 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CRTAC1Q9NQ79 661 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HSFX1Q9UBD0 423 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CDH9Q9ULB4 789 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ASB3Q9Y575 518 aa12.94□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KRBA1A5PL33 1030 aa12.93□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRIM49BA6NDI0 452 aa12.93□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HLA-DRAP01903 254 aa12.93□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FCARP24071 287 aa12.93□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 VIPR2P41587 438 aa12.93□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PMS1P54277 932 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CYP4F8P98187 520 aa12.93□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PPP3CAQ08209 521 aa12.93□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GRM2Q14416 872 aa12.93□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NFIL3Q16649 462 aa12.93□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EDRF1Q3B7T1 1238 aa12.93□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZACNQ401N2 412 aa12.93□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF667Q5HYK9 610 aa12.93□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MDH1BQ5I0G3 518 aa12.93□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IER5LQ5T953 404 aa12.93□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ANKRD40Q6AI12 368 aa12.93□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPOPLQ6IQ16 392 aa12.93□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KLHL10Q6JEL2 608 aa12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms