RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
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SENP6-211ENST00000493959 BRD9Q9H8M2 597 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 TRPV4Q9HBA0 871 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 EXOC1Q9NV70 894 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SENP6-211ENST00000493959 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
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SENP6-211ENST00000493959 FAM170BA6NMN3 283 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 EXOC3O60645 756 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 CYP4F8P98187 520 aa24.32■■□□□ 1.48
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SENP6-211ENST00000493959 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa24.32■■□□□ 1.48
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SENP6-211ENST00000493959 CGRRF1Q99675 332 aa24.32■■□□□ 1.48
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SENP6-211ENST00000493959 USP25Q9UHP3 1055 aa24.32■■□□□ 1.48
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SENP6-211ENST00000493959 NME7Q9Y5B8 376 aa24.31■■□□□ 1.48
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SENP6-211ENST00000493959 PDGFRBP09619 1106 aa24.3■■□□□ 1.48
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SENP6-211ENST00000493959 PSMD2Q13200 908 aa24.3■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 TAF12Q16514 161 aa24.3■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 TMEM150AQ86TG1 271 aa24.3■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 ELMO3Q96BJ8 720 aa24.3■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 MMS19Q96T76 1030 aa24.3■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 SLC46A2Q9BY10 475 aa24.3■■□□□ 1.48
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SENP6-211ENST00000493959 KCTD10Q9H3F6 313 aa24.3■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 FAM171BQ6P995 826 aa24.29■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 DPH6Q7L8W6 267 aa24.29■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 FRMD5Q7Z6J6 570 aa24.29■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 LTB4R2Q9NPC1 389 aa24.29■■□□□ 1.48
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SENP6-211ENST00000493959 A0A1W2PQ64 194 aa24.28■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 A0A1W2PQD8 194 aa24.28■■□□□ 1.48
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SENP6-211ENST00000493959 IRF7Q92985 503 aa24.28■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 TASP1Q9H6P5 420 aa24.28■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 CRTAC1Q9NQ79 661 aa24.28■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa24.28■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.28■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 CFAP54Q96N23 3096 aa24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 ZNF263O14978 683 aa24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 PRAMEF12O95522 483 aa24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 FGF19O95750 216 aa24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 WARSP23381 471 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 PCSK1P29120 753 aa24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 NLRP12P59046 1061 aa24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 DLG4P78352 724 aa24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 DPYDQ12882 1025 aa24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 FZD5Q13467 585 aa24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 GOLGA5Q8TBA6 731 aa24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 SPATA18Q8TC71 538 aa24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 PARD3BQ8TEW8 1205 aa24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 DNASE1L2Q92874 299 aa24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 ZFYVE19Q96K21 471 aa24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 SYT15Q9BQS2 421 aa24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa24.27■■□□□ 1.48
SENP6-211ENST00000493959 DENND4CQ5VZ89 1909 aa24.26■■□□□ 1.47
SENP6-211ENST00000493959 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SENP6-211ENST00000493959 ARNTLO00327 626 aa24.26■■□□□ 1.47
SENP6-211ENST00000493959 ZNF202O95125 648 aa24.26■■□□□ 1.47
SENP6-211ENST00000493959 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SENP6-211ENST00000493959 NBL1P41271 181 aa24.26■■□□□ 1.47
SENP6-211ENST00000493959 WDR72Q3MJ13 1102 aa24.26■■□□□ 1.47
SENP6-211ENST00000493959 C1orf210Q8IVY1 113 aa24.26■■□□□ 1.47
SENP6-211ENST00000493959 SCN4BQ8IWT1 228 aa24.26■■□□□ 1.47
SENP6-211ENST00000493959 TTC8Q8TAM2 541 aa24.26■■□□□ 1.47
SENP6-211ENST00000493959 XYLT2Q9H1B5 865 aa24.26■■□□□ 1.47
SENP6-211ENST00000493959 ABCB6Q9NP58 842 aa24.26■■□□□ 1.47
SENP6-211ENST00000493959 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa24.26■■□□□ 1.47
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