RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 BOLA3Q53S33 107 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 OR5B17Q8NGF7 314 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 LPPQ93052 612 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 ELOVL4Q9GZR5 314 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 KRT15P19012 456 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 PLTPP55058 493 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 KRT71Q3SY84 523 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 C1orf228Q6PIY5 440 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
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PTPRD-211ENST00000486161 CRYGNQ8WXF5 182 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 FBXO32Q969P5 355 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D31Q96DN5 1066 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 VCPIP1Q96JH7 1222 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.7□□□□□ -1.02
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PTPRD-211ENST00000486161 ATP2A3Q93084 1043 aa8.7□□□□□ -1.02
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PTPRD-211ENST00000486161 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 FBXO44Q9H4M3 255 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 C11orf49Q9H6J7 331 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 CPP00450 1065 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 MX2P20592 715 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 EPHB1P54762 984 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
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PTPRD-211ENST00000486161 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
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PTPRD-211ENST00000486161 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC85CA6NKD9 419 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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PTPRD-211ENST00000486161 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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PTPRD-211ENST00000486161 RASSF10A6NK89 507 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPRD-211ENST00000486161 PRKCIP41743 596 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPRD-211ENST00000486161 TKTL1P51854 596 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRD-211ENST00000486161 ROR1Q01973 937 aa8.69□□□□□ -1.02
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