RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SEL1LQ9UBV2 794 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 L1RE1Q9UN81 338 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 CCL26Q9Y258 94 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 ATG2BQ96BY7 2078 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 MYBPHLA2RUH7 354 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SPTLC2O15270 562 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 FGF19O95750 216 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 TXLNAP40222 546 aa13.59□□□□□ -0.23
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PRAME-212ENST00000485532 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 OSTM1Q86WC4 334 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SYCP3Q8IZU3 236 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 MAB21L3Q8N8X9 362 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 CXorf38Q8TB03 319 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 RIN3Q8TB24 985 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SPPL2BQ8TCT7 592 aa13.59□□□□□ -0.23
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PRAME-212ENST00000485532 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
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PRAME-212ENST00000485532 OLFML3Q9NRN5 406 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 PANK4Q9NVE7 773 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SIX4Q9UIU6 781 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 EXOC7Q9UPT5 735 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 PTPRJQ12913 1337 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 FRMD3A2A2Y4 597 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa13.58□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 CMTM8Q8IZV2 173 aa13.58□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 GKN1Q9NS71 199 aa13.58□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 K7ESF4 209 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 HRO43593 1189 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 EXTL3O43909 919 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 PPP6R2O75170 966 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 TADA3O75528 432 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 KRT19P08727 400 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 GARTP22102 1010 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 PNPLA4P41247 253 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 TSPY1Q01534 308 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 LRRC32Q14392 662 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 PKN3Q6P5Z2 889 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 PRR23BQ6ZRT6 265 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 NT5DC4Q86YG4 428 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 SPEM1Q8N4L4 309 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 OR5B17Q8NGF7 314 aa13.57□□□□□ -0.24
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PRAME-212ENST00000485532 CHFRQ96EP1 664 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 PKMYT1Q99640 499 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 HPS4Q9NQG7 708 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 GTF3C4Q9UKN8 822 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 USP18Q9UMW8 372 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 PCDHA7Q9UN72 937 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 SNX9Q9Y5X1 595 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa13.56□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 GOLGA6L22H0YM25 854 aa13.56□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 HUS1O60921 280 aa13.56□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 ATP2C2O75185 946 aa13.56□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 LDHAP00338 332 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 ARSAP15289 507 aa13.56□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 WEE1P30291 646 aa13.56□□□□□ -0.24
PRAME-212ENST00000485532 HOXD13P35453 343 aa13.56□□□□□ -0.24
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