RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484897.3

RPSAP58-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 58, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP58, Length 888 nt, Biotype processed pseudogene, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP58-201ENST00000484897 SMARCE1Q969G3 411 aa11.91□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 PSMG2Q969U7 264 aa11.91□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 SYT15Q9BQS2 421 aa11.91□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 LRRC3Q9BY71 257 aa11.91□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 SNX25Q9H3E2 840 aa11.91□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 ATXN3LQ9H3M9 355 aa11.91□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 RMND1Q9NWS8 449 aa11.91□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 GDE1Q9NZC3 331 aa11.91□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa11.91□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa11.91□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 MIA3Q5JRA6 1907 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 KRBA1A5PL33 1030 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 GABRDO14764 452 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 KINO60870 393 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 AKAP3O75969 853 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 SMC2O95347 1197 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 VNN1O95497 513 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 WARSP23381 471 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 AVPR2P30518 371 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 VIPR2P41587 438 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 PRCPP42785 496 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 CYP4F8P98187 520 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 CYP27A1Q02318 531 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 ADAM9Q13443 819 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 NCOA4Q13772 614 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 DDR2Q16832 855 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 ZNF699Q32M78 642 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 ITIH5Q86UX2 942 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 SCN4BQ8IWT1 228 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 FAM186BQ8IYM0 893 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 LEMD2Q8NC56 503 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 MYLPFQ96A32 169 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 ASB16Q96NS5 453 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 PKMYT1Q99640 499 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 XYLT2Q9H1B5 865 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 DPEP3Q9H4B8 488 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 SMYD3Q9H7B4 428 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 CRTAC1Q9NQ79 661 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 CHMP5Q9NZZ3 219 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 HSFX1Q9UBD0 423 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 ASB3Q9Y575 518 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 NME7Q9Y5B8 376 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP58-201ENST00000484897 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 TRIM49BA6NDI0 452 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 ECI2O75521 394 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 KRT13P13646 458 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 NPR3P17342 541 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 FCARP24071 287 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 RPL13P26373 211 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 PIK3CAP42336 1068 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 GCLMP48507 274 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 VAMP7P51809 220 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 AP3M2P53677 418 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 CDH8P55286 799 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 SMARCB1Q12824 385 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 ZCWPW2Q504Y3 356 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 ZNF667Q5HYK9 610 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 MDH1BQ5I0G3 518 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 C1orf220Q5T0J3 134 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 GPR158Q5T848 1215 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 SPOPLQ6IQ16 392 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 GAREM2Q75VX8 874 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 DPH6Q7L8W6 267 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 LIMS2Q7Z4I7 341 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 TMEM105Q8N8V8 129 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 SPATA18Q8TC71 538 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 TMC2Q8TDI7 906 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 SMARCD2Q92925 531 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 TIGD1Q96MW7 591 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 GSDMAQ96QA5 445 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 ZFP14Q9HCL3 533 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 ARHGEF3Q9NR81 526 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 WNT16Q9UBV4 365 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 CDH9Q9ULB4 789 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 NCANO14594 1321 aa11.88□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 A8MXQ7 604 aa11.88□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 BIN1O00499 593 aa11.88□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 PI15O43692 258 aa11.88□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 MICAL2O94851 1124 aa11.88□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 HLA-DRAP01903 254 aa11.88□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 BDNFP23560 247 aa11.88□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 ATICP31939 592 aa11.88□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 CLDN10P78369 228 aa11.88□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 NFIL3Q16649 462 aa11.88□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 ZACNQ401N2 412 aa11.88□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa11.88□□□□□ -0.51
RPSAP58-201ENST00000484897 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms