RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 LPAL2Q16609 132 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 DDR2Q16832 855 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC142Q17RM4 750 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 TXNDC8Q6A555 127 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 GAREM2Q75VX8 874 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 TMC8Q8IU68 726 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 MFSD6LQ8IWD5 586 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 OR5B17Q8NGF7 314 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 SPPL2BQ8TCT7 592 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 DNASE1L2Q92874 299 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 SNX21Q969T3 373 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 E2F7Q96AV8 911 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 STRA6Q9BX79 667 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 SNX25Q9H3E2 840 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 CUEDC2Q9H467 287 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 TMLHEQ9NVH6 421 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 INTS13Q9NVM9 706 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 NCDNQ9UBB6 729 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 SERTAD1Q9UHV2 236 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 ITGA11Q9UKX5 1188 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 CFAP45Q9UL16 551 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 PCDHA7Q9UN72 937 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 L1RE1Q9UN81 338 aa8.67□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 CEP250Q9BV73 2442 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 OBSL1O75147 1896 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 NCANO14594 1321 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 PTPRJQ12913 1337 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 FRMD3A2A2Y4 597 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 EXOC3O60645 756 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 ANXA13P27216 316 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 PCSK1P29120 753 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 GRIK1P39086 918 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 EPHA5P54756 1037 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 TNNC1P63316 161 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 TNK2Q07912 1038 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 MTAPQ13126 283 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 BIRC3Q13489 604 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 CUL4BQ13620 913 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 PON2Q15165 354 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 SURF1Q15526 300 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 E2F4Q16254 413 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 OSTM1Q86WC4 334 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 DCLK2Q8N568 766 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 OR6B3Q8NGW1 331 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 KCNN1Q92952 543 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 BORCS6Q96GS4 357 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 CHAMP1Q96JM3 812 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 SPATA32Q96LK8 384 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 SYT15Q9BQS2 421 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC3Q9BY71 257 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 TASP1Q9H6P5 420 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.028e-25■■■■■ 264
CTPS1-209ENST00000480420 EXOC1Q9NV70 894 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 SIX4Q9UIU6 781 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1B0GVL5 298 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 MYBPHLA2RUH7 354 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 CHADO15335 359 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 PRAMEF12O95522 483 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 CKMP06732 381 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 CSH1P0DML2 217 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 CSH2P0DML3 217 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 ID4P47928 161 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 LHX1P48742 406 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 CASP4P49662 377 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 NLRP12P59046 1061 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 PSMD2Q13200 908 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 PPP2R5DQ14738 602 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 SOWAHAQ2M3V2 549 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 UNC13DQ70J99 1090 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-209ENST00000480420 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
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