RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 KCTD3Q9Y597 815 aa6.57□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 IRAK3Q9Y616 596 aa6.57□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 INSRP06213 1382 aa6.57□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 PRSS47A8MTI9 375 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 H0YGN5 161 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 J3KRW8 73 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 JAG1P78504 1218 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 ITPK1Q13572 414 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 PFKFB4Q16877 469 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 VASNQ6EMK4 673 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF566Q969W8 418 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 DYDC2Q96IM9 177 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 NOX5Q96PH1 765 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 RMDN3Q96TC7 470 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 STK33Q9BYT3 514 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 PDP2Q9P2J9 529 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 DNAI1Q9UI46 699 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 SLX4Q8IY92 1834 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 ENDOD1O94919 500 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 ARIH2O95376 493 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 PFKLP17858 780 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 FGFR2P21802 821 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 DDIT3P35638 169 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 FLT3LGP49771 235 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 FOXO4P98177 505 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 UBE3CQ15386 1083 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 DGKDQ16760 1214 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 MST1LQ2TV78 715 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 ZACNQ401N2 412 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 HYIQ5T013 277 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 RSPH3Q86UC2 560 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 TMTC2Q8N394 836 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 TTLL6Q8N841 843 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 DTX3Q8N9I9 347 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 MAML1Q92585 1016 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 DDX11Q96FC9 970 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 PPM1MQ96MI6 270 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 LDAHQ9H6V9 325 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF186Q9NXI6 227 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 CEP83Q9Y592 693 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF123Q5XPI4 1314 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 LGALS16A8MUM7 142 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 NPC1O15118 1278 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 ARHGAP6O43182 974 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 AHSGP02765 367 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 CFPP27918 469 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 PRDX5P30044 214 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 SREBF1P36956 1147 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 CASP2P42575 452 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 GLRBP48167 497 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 ARFIP2P53365 341 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 FZD5Q13467 585 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB39AQ14964 217 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 TAF5Q15542 800 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 STK32CQ86UX6 486 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADBP1-201ENST00000478954 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
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