RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477144.1

HOXB-AS3-209, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 743 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MAN1A1P33908 653 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CDH8P55286 799 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAAP100Q0VG06 881 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MAP9Q49MG5 647 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PASD1Q8IV76 773 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 URGCPQ8TCY9 931 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 APBB2Q92870 758 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 WNT8BQ93098 351 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ADAM2Q99965 735 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KANSL3Q9P2N6 904 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DSEQ9UL01 958 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 M0QYV0 167 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PITPNM1O00562 1244 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RRM1P23921 792 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CTNNA2P26232 953 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RAP1GAPP47736 663 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LHX1P48742 406 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GUCY2FP51841 1108 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RWDD2BP57060 319 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FPGSQ05932 587 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GRIK3Q13003 919 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DSC3Q14574 896 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BRD3Q15059 726 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ODF2Q5BJF6 829 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLC24A5Q71RS6 500 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 METTL23Q86XA0 190 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C3orf20Q8ND61 904 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FEZF2Q8TBJ5 459 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ANKRD7Q92527 254 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C18orf8Q96DM3 657 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TBX21Q9UL17 535 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MTUS1Q9ULD2 1270 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MYH10P35580 1976 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ARL5CA6NH57 179 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HOXA2O43364 376 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 COMTP21964 271 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 WARSP23381 471 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CXCR5P32302 372 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MLH1P40692 756 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DNA2P51530 1060 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 EPHB4P54760 987 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GSCP56915 257 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LILRA4P59901 499 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MAMLD1Q13495 774 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 COG1Q8WTW3 980 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 STK32AQ8WU08 396 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GAD1Q99259 594 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PSMB7Q99436 277 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZSWIM1Q9BR11 485 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRPV6Q9H1D0 765 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RNF39Q9H2S5 420 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CYLDQ9NQC7 956 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RGS18Q9NS28 235 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 COG5Q9UP83 839 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 O00370 1275 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PODXLO00592 558 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CYB561D2O14569 222 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF185O15231 689 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PSTPIP1O43586 416 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MICAL2O94851 1124 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PROSCO94903 275 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TIMP1P01033 207 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ODC1P11926 461 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ACADSBP45954 432 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ACAP1Q15027 740 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms