RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 RRAGAQ7L523 313 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 USP37Q86T82 979 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM57Q8N5G2 664 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 CEP95Q96GE4 821 aa6.85□□□□□ -1.31
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RABGGTB-209ENST00000473406 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.85□□□□□ -1.31
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RABGGTB-209ENST00000473406 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 H7C4K7 107 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 CCP110O43303 1012 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 PLOD3O60568 738 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP7B1O75881 506 aa6.84□□□□□ -1.31
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RABGGTB-209ENST00000473406 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
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RABGGTB-209ENST00000473406 WNT3P56703 355 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.84□□□□□ -1.31
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 RSC1A1Q92681 617 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA1Q92805 767 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNH6Q9H252 994 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT84Q9NSB2 600 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-209ENST00000473406 COQ9O75208 318 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 CASRP41180 1078 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 MRE11P49959 708 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 DOC2BQ14184 412 aa6.83□□□□□ -1.32
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RABGGTB-209ENST00000473406 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.83□□□□□ -1.32
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RABGGTB-209ENST00000473406 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.83□□□□□ -1.32
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RABGGTB-209ENST00000473406 PI4KAP2A4QPH2 592 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
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RABGGTB-209ENST00000473406 ATG16L1Q676U5 607 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
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RABGGTB-209ENST00000473406 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
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RABGGTB-209ENST00000473406 NOD2Q9HC29 1040 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 DKK4Q9UBT3 224 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 DAPP1Q9UN19 280 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
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