RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472045.1

IRF1-208, Transcript of interferon regulatory factor 1, human

TSL 2

Gene IRF1, Length 5,153 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF1-208	ENST00000472045	RNF135	Q8IUD6	432 aa		12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	RNF217	Q8TC41	542 aa		12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	TTC17	Q96AE7	1141 aa		12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	CENPK	Q9BS16	269 aa		12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	HIPK3	Q9H422	1215 aa		12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	SUN2	Q9UH99	717 aa		12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	MEIS2	O14770	477 aa		12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	GSTA4	O15217	222 aa		12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	NDUFS3	O75489	264 aa		12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	SETSIP	P0DME0	302 aa		12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	SCNN1G	P51170	649 aa		12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	SV2A	Q7L0J3	742 aa		12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		12.83	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	WEE1	P30291	646 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	ITGA7	Q13683	1181 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	ALS2CL	Q60I27	953 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	LBX2	Q6XYB7	198 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	IPMK	Q8NFU5	416 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	HIST1H2AD	P20671	130 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	MLH1	P40692	756 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	HADHA	P40939	763 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	MTF1	Q14872	753 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	HIF1A	Q16665	826 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	SPATA18	Q8TC71	538 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	CCDC151	A5D8V7	595 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	FZD9	O00144	591 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	ADCY6	O43306	1168 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	TLL1	O43897	1013 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	SGPL1	O95470	568 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	OXCT1	P55809	520 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	PNMA5	Q96PV4	448 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	VPS28	Q9UK41	221 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	CST8	O60676	142 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	COMT	P21964	271 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	TMPRSS15	P98073	1019 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	RASA4B	C9J798	803 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	RASA4	O43374	803 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	KIF19	Q2TAC6	998 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	IL31RA	Q8NI17	732 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	USP20	Q9Y2K6	914 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	PSMD10	O75832	226 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	AKAP3	O75969	853 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	RHOC	P08134	193 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	TYK2	P29597	1187 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	STARD3	Q14849	445 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	PKP3	Q9Y446	797 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	CCDC78	A2IDD5	438 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	SMIM24	O75264	130 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	CD52	P31358	61 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	NNT	Q13423	1086 aa		12.81	□□□□□ -0.36
IRF1-208	ENST00000472045	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		12.81	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms