RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRPC3Q13507 836 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 DNASE1L2Q92874 299 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 E2F7Q96AV8 911 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 GCNAQ96QF7 691 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 MMS19Q96T76 1030 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 SYT15Q9BQS2 421 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDH9Q9ULB4 789 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAPK13O15264 365 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 HCRTO43612 131 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 TACC1O75410 805 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM163BP0C2L3 166 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 GABRR2P28476 465 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDR1P51861 262 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 STARD6P59095 220 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 TAF12Q16514 161 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM171BQ6P995 826 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMC2Q8TDI7 906 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 IL21Q9HBE4 155 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 RMND1Q9NWS8 449 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 COL4A3Q01955 1670 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 PI15O43692 258 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 PHACTR2O75167 634 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 PSMC3P17980 439 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 NR2F2P24468 414 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAGEA11P43364 429 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYL6P60660 151 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 BIRC3Q13489 604 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 CEP135Q66GS9 1140 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 VITQ6UXI7 678 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 GIPC2Q8TF65 315 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 STK25O00506 426 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 CSH1P0DML2 217 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 CSH2P0DML3 217 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYP2F1P24903 491 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 LMO2P25791 158 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 WEE1P30291 646 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 VIPR2P41587 438 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 ENPEPQ07075 957 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 PNOCQ13519 176 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 NCOA4Q13772 614 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 GRM2Q14416 872 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC142Q17RM4 750 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF699Q32M78 642 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC44A4Q53GD3 710 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPR158Q5T848 1215 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 PJA1Q8NG27 643 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYLPFQ96A32 169 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 TIGD1Q96MW7 591 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 SNX25Q9H3E2 840 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 IKBKBO14920 756 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPR15P49685 360 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 DLG4P78352 724 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZACNQ401N2 412 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 IRF7Q92985 503 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 GSDMAQ96QA5 445 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 TASP1Q9H6P5 420 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 BRD9Q9H8M2 597 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms