RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462332.1

GTPBP1-206, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 3,035 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-206	ENST00000462332	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	SAR1A	Q9NR31	198 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	PARP2	Q9UGN5	583 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	NENF	Q9UMX5	172 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	WDR90	Q96KV7	1748 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332		K7ENM7	598 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	AKAP3	O75969	853 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	CDK4	P11802	303 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	SLC9A1	P19634	815 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	MUT	P22033	750 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	SERPINB8	P50452	374 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	CYP2J2	P51589	502 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	HDAC4	P56524	1084 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	PDE1B	Q01064	536 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	MPP2	Q14168	576 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	JAML	Q86YT9	394 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	DAW1	Q8N136	415 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	WDR64	B1ANS9	1081 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	CCDC22	O60826	627 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	RARG	P13631	454 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	RARRES1	P49788	294 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	ARID5A	Q03989	594 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	MAPK7	Q13164	816 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	XKR9	Q5GH70	373 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	TGFB1I1	O43294	461 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	FOXN2	P32314	431 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	EMP3	P54852	163 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	JAM2	P57087	298 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	IL9R	Q01113	521 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	PTK2	Q05397	1052 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	ACAD11	Q709F0	780 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	GAB3	Q8WWW8	586 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	GLG1	Q92896	1179 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	FNBP1	Q96RU3	617 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	FIZ1	Q96SL8	496 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	NR2E1	Q9Y466	385 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	MYH11	P35749	1972 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	PFAS	O15067	1338 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	TISP43	B9A030	160 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	PDE5A	O76074	875 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	OR6B1	O95007	311 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	ACTN1	P12814	892 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	SOX10	P56693	466 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	KRT76	Q01546	638 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	MOGS	Q13724	837 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	SLC35C1	Q96A29	364 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	SIX2	Q9NPC8	291 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	ATP2A1	O14983	1001 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	GRIA2	P42262	883 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	JAK3	P52333	1124 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	PSMC5	P62195	406 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	WDR78	Q5VTH9	848 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	LBX2	Q6XYB7	198 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	RDH13	Q8NBN7	331 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	FNDC8	Q8TC99	324 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	GPRASP2	Q96D09	838 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	UBE4B	O95155	1302 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	PTPRF	P10586	1907 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-206	ENST00000462332	GSC2	O15499	205 aa		11.96	□□□□□ -0.5
GTPBP1-206	ENST00000462332	EXOC3	O60645	756 aa		11.96	□□□□□ -0.5
GTPBP1-206	ENST00000462332	ZWINT	O95229	277 aa		11.96	□□□□□ -0.5

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