RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 M0QYV0 167 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 M0QZQ0 153 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 KIAA0355O15063 1070 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 TRAPPC3O43617 180 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 B3GAT3O94766 335 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 CALCAP01258 141 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 TYMPP19971 482 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 PCSK1P29120 753 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 IKBKEQ14164 716 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 RPS6KA1Q15418 735 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 CLLU1OSQ5K130 101 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 PEX26Q7Z412 305 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 MNS1Q8NEH6 495 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 STK32AQ8WU08 396 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 SCLYQ96I15 445 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 C11orf70Q9BRQ4 267 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 OSGEPQ9NPF4 335 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 RNF19AQ9NV58 838 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 TBC1D13Q9NVG8 400 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 TSPAN16Q9UKR8 245 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 AMFRQ9UKV5 643 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-203ENST00000460759 SCN5AQ14524 2016 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 ENC1O14682 589 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 TIMP1P01033 207 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 EN2P19622 333 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 RRM1P23921 792 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 CYP2C18P33260 490 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 SLC1A1P43005 524 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 BCAT1P54687 386 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 CCL23P55773 120 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 SLC8A3P57103 927 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 PTP4A2Q12974 167 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 CLUL1Q15846 466 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 LRRC26Q2I0M4 334 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 DENND1BQ6P3S1 775 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 DNAJC24Q6P3W2 148 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 ACOT1Q86TX2 421 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 DNAAF5Q86Y56 855 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 COLGALT2Q8IYK4 626 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 C3orf20Q8ND61 904 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 SUSD3Q96L08 255 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 TMEM175Q9BSA9 504 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 TLR10Q9BXR5 811 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 SYNCQ9H7C4 482 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 ABCB6Q9NP58 842 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 CDH9Q9ULB4 789 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 COG5Q9UP83 839 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 MYO1FO00160 1098 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 FTCDO95954 541 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 CFHP08603 1231 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 FGFR1P11362 822 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 MAN1A1P33908 653 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 GPD2P43304 727 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 GABRB2P47870 512 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 BST2Q10589 180 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 PDCLQ13371 301 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 ORC1Q13415 861 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 PKDCCQ504Y2 493 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 WSCD1Q658N2 575 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 NT5DC3Q86UY8 548 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 CRIPAKQ8N1N5 446 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 THEM5Q8N1Q8 247 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 LRRC43Q8N309 656 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 TMEM199Q8N511 208 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 UBL4BQ8N7F7 174 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 ANKRD52Q8NB46 1076 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 C3orf58Q8NDZ4 430 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 C18orf8Q96DM3 657 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 PBKQ96KB5 322 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 OSBPL9Q96SU4 736 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 ANAPC7Q9UJX3 599 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 PCDHB8Q9UN66 801 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 SYN3O14994 580 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 BAIAP3O94812 1187 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 ACADSBP45954 432 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 PLCB3Q01970 1234 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 MAMLD1Q13495 774 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 PTPN20Q4JDL3 420 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 TIGD5Q53EQ6 642 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-203ENST00000460759 DEFB128Q7Z7B8 93 aa13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms